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川上 純司 (カワカミ ジュンジ)

KAWAKAMI Junji

職名

教授

学位

博士(薬学)(北海道大学), 薬学修士(大阪大学)

外部リンク

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 北海道大学大学院   薬学研究科   製薬化学専攻   卒業

    1991年4月 - 1994年3月

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  • 大阪大学大学院   薬学研究科   薬品化学専攻   卒業

    1989年4月 - 1991年3月

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  • 大阪大学   薬学部   製薬化学科   卒業

    1985年4月 - 1989年3月

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出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 北海道大学   薬学研究科   製薬化学専攻   博士課程   修了

    1991年4月 - 1994年3月

  • 大阪大学   薬学研究科   薬品化学専攻   修士課程   修了

    1989年4月 - 1991年3月

留学歴 【 表示 / 非表示

  • 2001年3月
    -
    2002年3月

    Yale大学   客員研究員

学内職務経歴 【 表示 / 非表示

  • 甲南大学   フロンティアサイエンス学部 生命化学科   教授

    2009年4月 - 現在

  • 甲南大学   理工学部 機能分子化学科   准教授

    2007年4月 - 2009年3月

  • 甲南大学   理工学部 機能分子化学科   助教授

    2005年4月 - 2007年3月

  • 甲南大学   理工学部 機能分子化学科   講師

    2001年4月 - 2005年3月

  • 甲南大学   理学部 化学科   講師

    1996年4月 - 2001年3月

学外略歴 【 表示 / 非表示

  • Professor, Department of Nanobiochemistry, FIRST, Konan University

    2009年 - 現在

  • 甲南大学 フロンティアサイエンス学部 教授

    2009年 - 現在

  • Associate Professor, Faculty of Science and Engineering, Konan University

    2005年 - 2009年

  • Visiting Fellow, Yale University

    2001年 - 2002年

  • YALE大学 客員研究員

    2001年 - 2002年

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所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 高分子学会

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  • 高分子学会

    1996年4月 - 現在

  • 日本薬学会

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  • 日本薬学会

    1990年4月 - 現在

  • 日本生化学会

    1991年4月 - 2019年7月

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論文 【 表示 / 非表示

  • 製造委託の際に知っておきたい核酸医薬の特性ー品質と安全性評価面を中心に

    川上 純司

    Pharm Tech Japan   38 ( 12 )   2017 - 2022   2022年9月

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    担当区分:筆頭著者  

    researchmap

  • Actin Filament in the First Cell Cycle Contributes to the Determination of the Anteroposterior Axis in Ascidian Development 査読あり

    Toshiyuki Goto, Shuhei Torii, Aoi Kondo, Kazumasa Kanda, Junji Kawakami, Yosky Kataoka, Takahito Nishikata

    Journal of Developmental Biology   10 ( 1 )   10 - 10   2022年2月

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    出版者・発行元:MDPI AG  

    In many animal species, the body axis is determined by the relocalization of maternal determinants, organelles, or unique cell populations in a cytoskeleton-dependent manner. In the ascidian first cell cycle, the myoplasm, including mitochondria, endoplasmic reticulum (ER), and maternal mRNAs, move to the future posterior side concomitantly (called ooplasmic segregation or cytoplasmic and cortical reorganization). This translocation consists of first and second phases depending on the actin and microtubule, respectively. However, the transition from first to second phase, that is, translocation of myoplasmic components from microfilaments to microtubules, has been poorly investigated. In this study, we analyzed the relationship between these cytoskeletons and myoplasmic components during the first cell cycle and their role in morphogenesis by inhibitor experiments. Owing to our improved visualization techniques, there was unexpected F-actin accumulation at the vegetal pole during this transition period. When this F-actin was depolymerized, the microtubule structure was strongly affected, the myoplasmic components, including maternal mRNA, were mislocalized, and the anteroposterior axis formation was disordered. These results suggested the importance of F-actin during the first cell cycle and the existence of interactions between microfilaments and microtubules, implying the enigmatic mechanism of ooplasmic segregation. Solving this mystery leads us to an improved understanding of ascidian early development.

    DOI: 10.3390/jdb10010010

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  • An improved synthesis of 2′-<i>O</i>,4′-<i>C</i>-ethylene nucleic acid (ENA) and thermodynamic studies of duplex formation containing the guanosine ENA unit 査読あり

    Miho Takagi-Sato, Koji Morita, Yoshiyuki Onishi, Yuuka Watahiki, Taku Ishigaki, Tomoka Akita, Erisa Tomita, Junji Kawakami, Makoto Koizumi

    Nucleosides, Nucleotides &amp; Nucleic Acids   39 ( 6 )   838 - 852   2020年6月

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    出版者・発行元:Informa UK Limited  

    DOI: 10.1080/15257770.2019.1708389

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  • 好熱性細菌および酵母菌による多段階培養発酵技術から得られた 発酵エキスの皮膚に対する有用性 査読あり

    川野 大地, 廖 筝筝, 聶 菁, 伊達 朗, Eduardo Perez, Jose Fernandez, Corey Webb, Kristen Huber, Jeffry B. Stock, 川上 純司, 付 子華

    日本香粧品学会誌   44 ( 3 )   194 - 202   2020年

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  • Different reactivity of Sp and Rp isomers of phosphorothioate-modified oligonucleotides in a duplex structure 査読あり

    Md Ariful Islam, Aki Fujisaka, Junji Kawakami, Takao Yamaguchi, Satoshi Obika

    Bioorg. Med. Chem. Lett.   30 ( 14 )   127166 - 127166   2020年

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • 核酸医薬品のCMC管理戦略 −品質評価・不純物管理−

    冨田恵麗沙, 秋田智香, 川上純司( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 核酸医薬品と核酸化学)

    サイエンス&テクノロジー  2022年9月  ( ISBN:9784864282925

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  • 実験医学 (Experimental Medicine)

    秋田智香, 川上純司( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 核酸医薬の化学 総論-修飾核酸と機能評価)

    実験医学  2021年11月 

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  • 核酸科学ハンドブック

    川上純司( 担当: 分担執筆 ,  範囲: アンチセンス核酸のメカニズム)

    講談社  2020年12月  ( ISBN:9784065207864

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  • 医薬品開発における中分子領域(核酸医薬・ペプチド医薬)の開発戦略

    川上 純司( 範囲: アンチセンス核酸医薬の作用機序)

    情報機構  2019年10月 

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  • ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース③ 細胞培養トレーニング

    西方敬人, 川上純司, 藤井敏司, 長濱宏治, 川内敬子( 担当: 共著)

    学研メディカル秀潤社  2015年4月  ( ISBN:9784780909036

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総説・解説記事(Misc) 【 表示 / 非表示

  • Triplet analysis that identifies unpaired regions of functional RNAs

    Junji Kawakami, Yoshie Yamaguchi, Naoki Sugimoto

    Journal of Nucleic Acids   2011   2011年

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    We developed a novel method for analyzing RNA sequences, deemed triplet analysis, and applied the method in an in vitro RNA selection experiment in which HIV-1 Tat was the target. Aptamers are nucleic acids that bind a desired target (bait), and to date, many aptamers have been identified by in vitro selection from enough concentrated libraries in which many RNAs had an obvious consensus primary sequence after sufficient cycles of the selection. Therefore, the higher-order structural features of the aptamers that are indispensable for interaction with the bait must be determined by additional investigation of the aptamers. In contrast, our triplet analysis enabled us to extract important information on functional primary and secondary structure from minimally concentrated RNA libraries. As a result, by using our method, an important unpaired region that is similar to the bulge of TAR was readily predicted from a partially concentrated library in which no consensus sequence was revealed by a conventional sequence analysis. Moreover, our analysis method may be used to assess a variety of structural motifs with desired function. © 2011 Junji Kawakami et al.

    DOI: 10.4061/2011/471843

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  • Pyrrolidinyl peptide nucleic acid with α/β-peptide backbone - A conformationally constrained PNA with unusual hybridization properties

    C. Vilaivan, C. Srisuwannaket, C. Ananthanawat, C. Suparpprom, J. Kawakami, Y. Yamaguchi, Y. Tanaka, T. Vilaivan

    Artificial DNA: PNA & XNA   2   11   2011年

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  • Comparative thermodynamic analysis of RNA-protein interaction on surface and in solution

    Y. Tanaka, K. Ishidate, K. Kishimoto, N. Sugimoto, J. Kawakami

    Proc. 37th Intl. Symp. Nucleic Acids Chemistry   276   2010年

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  • Accurate curve fitting procedure for UV melting analysis of highly thermostable RNA hairpins

    J. Kawakami, Y. Tanaka, K. Kishimoto

    Nucleic Acids Symp. Ser.   53   227   2009年

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  • Recognition of a flipped base in a hairpinloop DNA by a small peptide

    Junji Kawakami, Shinji Okabe, Yoshiatsu Tanabe, Naoki Sugimoto

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   27 ( 3 )   292 - 308   2008年3月

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    出版者・発行元:TAYLOR & FRANCIS INC  

    Two tiny hairpin DNAs, CORE (dAGGCTTCGGCCT) and AP2 (dAGGCTXCGGCCT,X:abasic nucleotide), fold into almost the same tetraloop hairpin structure with one exception, that is, the sixth thymine (T6) of CORE is exposed to the solvent water (Kawakami, J et al., Chem. Lett. 2001, 258-259). In the present study, we selected small peptides that bind to CORE or AP2 from a combinatorial pentapeptide library with 2.5 x 106 variants. On the basis of the structural information, the selected peptide sequences should indicate the essential qualifications for recognition of the hairpin loop DNA with and without a flipped base. In the selected DNA binding peptides, aromatic amino acids such as histidine for CORE and glutamine/aspartic acid for AP2 were found to be abundant amino acids. This amino acid preference suggests that CORE-binding peptides use)pi-pi stacking to recognize the target while hydrogen bonding is dominant for AP2-binding peptides. To investigate the binding properties of the selected peptide to the target, surface plasmon resonance was used. The binding constant of the interaction between CORE and a CORE-binding peptide (HWHHE) was about 1.1 x 10(6) M-1 at 25 degrees C and the resulting binding free energy change at 25 degrees C (Delta G(25)degrees) was - 8.2 kcal mol(-1). The binding of the peptide to AP2 was also analyzed and the resulting binding constant and Delta G(25)degrees were about 4.2 x 10(4) M-1 and -63 kcal mol(-1), respectively. The difference in the binding free energy changes (Delta Delta G(25)degrees) of 1.9 kcal mol(-1) was comparable to the values reported in other systems and was considered a consequence of the loss of pi-pi stacking. Moreover, the stabilization effect by stacking affected the dissociation step as well as the association step. Our results suggest that the existence Of an aromatic ring (T6 base) produces new dominant interactions between peptides and nucleic acids, although hydrogen bonding is the preferable mode of interaction in the absence of the flipping base. These findings regarding CORE and AP2 recognition are expected to give useful information in the design of novel artificial DNA binding peptides.

    DOI: 10.1080/15257770701845261

    researchmap

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講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • 『毒と薬の話』~違いが分かりますか?~ 招待あり

    川上 純司

    甲南大学 第540回 月例会  2023年2月 

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    開催年月日: 2023年2月

  • ポリフェノール活性化ブドウ種子エキスのUV防御能の評価

    川野 大地, 川上 純司, 付 子華

    第45回日本分子生物学会年会  (幕張メッセ)  2022年12月  深川 竜郎

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

  • アンチセンス核酸医薬のモデルとしてのRNA/DNA二重鎖におけるRNA鎖長が熱力学的パラメータに与える影響

    冨田 恵麗沙, 秋田 智香, 柏木 歩夢, 佐野 蓮心, 畠中 陸希, 井上 貴雄, 小比賀 聡, 川上 純司

    第45回日本分子生物学会年会  (幕張メッセ)  2022年11月  深川 竜郎

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

  • カリウム/ナトリウムイオン共存下におけるG4アプタマーの構造安定性

    石垣 卓, 廣瀬 雅子, 加藤 眞紀, 川上 純司

    第45回日本分子生物学会年会  (幕張メッセ)  2022年11月  深川 竜郎

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

  • 環状RNAを自己触媒的に調製するリガーゼリボザイム配列の最適化

    清瀬 茜, 川上 純司

    第45回日本分子生物学会年会  (幕張メッセ)  2022年11月  深川 竜郎

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

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科研費(文科省・学振)獲得実績 【 表示 / 非表示

  • ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価

    2004年4月 - 2006年3月

    学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)

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    ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
    領域・整理
    ・課題番号
    4706
    7305
    16750150

  • ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価

    2004年4月 - 2006年3月

    学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)

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    ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
    領域・整理
    ・課題番号
    4706
    7305
    16750150

  • ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価

    2004年4月 - 2006年3月

    学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)

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    ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
    領域・整理
    ・課題番号
    4706
    7305
    16750150

共同研究希望テーマ 【 表示 / 非表示

  • 新規機能性核酸(アプタマー等)の取得

  • リアルタイムPCR等を使用した遺伝子の定量解析

  • 人為的遺伝子発現調節(翻訳)

研究費にかかる研究(調査)活動報告書 【 表示 / 非表示

  • 2021年度  核酸医薬、RNA工学、遺伝子工学 アンチセンス核酸医薬の薬効予測法の開発

    研究費の種類: その他

  • 2020年度  核酸医薬、RNA工学、遺伝子工学 アンチセンス核酸医薬の薬効予測法の開発

    研究費の種類: その他

 

その他教育活動及び特記事項 【 表示 / 非表示

  • 2009年4月
    -
    現在

    ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース① 実験の基本と原理

  • 2009年4月
    -
    現在

    ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース② 実習編

  • 2009年4月
    -
    現在

    ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース③ 細胞培養トレーニング

  • 2019年7月
     
     

    ベストレクチャー研修会

  • 2014年12月
     
     

    FDワークショップ「Reflective Teaching - Understanding why we do what we do in the classroom?」

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所属学協会等の委員歴 【 表示 / 非表示

  • 2015年4月 - 現在   日本核酸医薬学会  評議員、幹事、事務局

  • 2016年9月 - 現在   日本核酸化学会  評議員

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  • 2004年4月 - 2017年3月   高分子学会  バイオ・高分子研究会 運営委員

  • 2015年12月 - 現在   日本核酸医薬学会  事務局長

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  • 2015年4月 - 現在   日本核酸医薬学会  評議員

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社会貢献活動 【 表示 / 非表示

  • 出張模擬講義

    2014年12月

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    毒学 - 薬学へのいざない/兵庫県立舞子高等学校

  • 模擬講義

    2014年12月

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    毒学/兵庫大学附属須磨ノ浦高等学校

  • サイエンスパートナーシッププロジェクト

    2014年8月

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    自然科学入門講座「身近な生活から最先端の遺伝子研究について学ぶ」- 遺伝子鑑定/兵庫県立星陵高等学校

  • etc

    2014年3月

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    遺伝子鑑定の精度・信憑性/兵庫県警察本部 刑事部

  • 模擬講義

    2013年12月

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    くすりの科学/須磨ノ浦女子高等学校

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提供可能な資源 【 表示 / 非表示

  • 生体高分子の合成・精製

    生体高分子の合成・精製

  • 原核生物を用いたバイオテクノロジー

    原核生物を用いたバイオテクノロジー

  • 分子間相互作用解析

    分子間相互作用解析