川上 純司 (カワカミ ジュンジ)
KAWAKAMI Junji
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職名 |
教授 |
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学位 |
博士(薬学)(北海道大学), 薬学修士(大阪大学) |
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専門分野 |
薬系分析、物理化学, 生物分子化学, 生体化学, 分子生物学, 構造生物化学 |
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外部リンク |
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出身学校 【 表示 ／ 非表示 】
出身大学院 【 表示 ／ 非表示 】
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北海道大学 薬学研究科 製薬化学専攻 博士課程 修了
1991年4月 - 1994年3月
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大阪大学 薬学研究科 薬品化学専攻 修士課程 修了
1989年4月 - 1991年3月
学内職務経歴 【 表示 ／ 非表示 】
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甲南大学 フロンティアサイエンス学部 生命化学科 教授
2009年4月 - 現在
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甲南大学 理工学部 機能分子化学科 准教授
2007年4月 - 2009年3月
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甲南大学 理工学部 機能分子化学科 助教授
2005年4月 - 2007年3月
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甲南大学 理工学部 機能分子化学科 講師
2001年4月 - 2005年3月
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甲南大学 理学部 化学科 講師
1996年4月 - 2001年3月
学外略歴 【 表示 ／ 非表示 】
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Professor, Department of Nanobiochemistry, FIRST, Konan University
2009年 - 現在
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甲南大学 フロンティアサイエンス学部 教授
2009年 - 現在
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Associate Professor, Faculty of Science and Engineering, Konan University
2005年 - 2009年
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Visiting Fellow, Yale University
2001年 - 2002年
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YALE大学 客員研究員
2001年 - 2002年
所属学協会 【 表示 ／ 非表示 】
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高分子学会
1996年4月 - 現在
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日本薬学会
1990年4月 - 現在
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日本生化学会
1991年4月 - 2019年7月
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Hiroyuki Togawa, Takashi Okubo, Kazuki Horiuchi, Takao Yamaguchi, Elisa Tomita-Sudo, Tomoka Akita, Junji Kawakami, Satoshi Obika
Journal of Chromatography A 1721 464847 2024年4月
共著
In recent years, several small interfering RNA (siRNA) therapeutics have been approved, and most of them are phosphorothioate (PS)-modified for improving nuclease resistance. This chemical modification induces chirality in the phosphorus atom, leading to the formation of diastereomers. Recent studies have revealed that Sp and Rp configurations of PS modifications of siRNAs have different biological properties, such as nuclease resistance and RNA-induced silencing complex (RISC) loading. These results highlight the importance of determining diastereomeric distribution in quality control. Although various analytical approaches have been used to separate diastereomers (mainly single-stranded oligonucleotides), it becomes more difficult to separate all of them as the number of PS modifications increases. Despite siRNA exhibits efficacy in the double-stranded form, few reports have examined the separation of diastereomers in the double-stranded form. In this study, we investigated the applicability of non-denaturing anion-exchange chromatography (AEX) for the separation of PS-modified siRNA diastereomers. Separation of the four isomers of the two PS bonds tended to improve in the double-stranded form compared to the single-stranded form. In addition, the effects of the analytical conditions and PS-modified position on the separation were evaluated. Moreover, the elution order of the Sp and Rp configurations was confirmed, and the steric difference between them, i.e., the direction of the anionic sulfur atom, appeared to be important for the separation mechanism in non-denaturing AEX. Consequently, all 16 peak tops of the four PS modifications were detected in one sequence, and approximately 30 peak tops were detected out of 64 isomers of six PS bonds, indicating that non-denaturing AEX is a useful technique for the quality control of PS-modified siRNA therapeutics.
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Kaoru Karasawa, Eva Duchoslav, Lyle Burton, Junji Kawakami, Takashi Baba
Analytical Chemistry 95 ( 44 ) 16352 - 16358 2023年10月
共著
We report the first sequencing of morpholino antisense oligonucleotides (phosphorodiamidate morpholino oligomers, PMOs) using electron capture dissociation (ECD) mass spectrometry. In this research, we found dissociation of the backbone of 18- to 25-mer PMOs to produce d and z ions as the major ions, and 100% cleavage coverage (sequence coverage) was obtained with these ions. This is a critical contrast with beam-type collision-induced dissociation, which dominantly induces base loss, so it is difficult to obtain sequence information. The results showed that an electron beam energy (typically 15 eV) can be used universally for PMOs with different sequences, lengths, and charge states so that no detailed optimization is required for multiprecursor targeting liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry measurements. We also confirmed that the ECD reaction speed was compatible with the high-performance liquid chromatography time scale. Finally, we demonstrated a liquid chromatography electron capture dissociation tandem mass spectrometry workflow to survey the modification sites of the emulated PMO impurities.
DOI： 10.1021/acs.analchem.3c03621
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Mitochondrial Dynamics of Bcl-2 Family Proteins during 17-β-Estradiol-Induced Apoptosis Correlate with the Malignancy of Endometrial Cancer Cells 査読あり
Takahiro Yaguchi, Misaki Kameno, Hirofumi Taira, and Junji Kawakami
Biochemstry 62 ( 21 ) 3041 - 3049 2023年10月
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複数種の液体クロマトグラフ質量分析計を用いたモデル核酸医薬品の分析データの比較 査読あり
Kenji Hirose, Tokuyuki Yoshida, Maki Terasaki, Hiroshi Sezaki, Kaoru Karasawa, Noriyuki Iwasaki, Kentaro Takahara, Naomi Takiguchi, Mitsuaki Sekiguchi, Hirokazu Nankai, Emi Saito, Hideaki Sato, Takashi Osawa, Takao Yamaguchi, Kosuke Ito, Junji Kawakami, Satoshi Obika, and Takao Inoue
54 439 - 454 2023年10月
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Not all 2',4'-bridged modifications stabilize DNA/RNA duplexes 査読あり
Tomoka Akita, Elisa Tomita-Sudo, Shin Itoh, Nae Sakimoto, Takeshi Masuda, Akifumi Nakamura, Yoshiyuki Onishi, Makoto Koizumi Junji Kawakami
Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids 2023年3月
共著
2’,4’-Bridged modifications such as 2’-O,4’-C-methylene-bridged nucleotides (LNAs) and 2’-O,4’-C-ethylene-bridged nucleotides (ENAs) provide high binding affinity for duplex formation. Stabilization by the introduction of the bridged nucleic acids is considered to be due to pre-organization. In this study, we found that the introduction of 2’,4’-C-bridged 2’-deoxynucleotides (CRNs; Conformationally Restricted Nucleotides) into DNA/RNA duplexes leads to destabilization, as opposed to the previously accepted notion that 2’,4’-bridged modifications always lead to stabilization.
その他リンク： https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15257770.2023.2232414
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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核酸医薬 モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向
冨田恵麗沙、秋田智香、川上純司（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 核酸医薬の不純物と管理）
NTS 2024年4月 （ ISBN:978-4-86043-886-9 ）
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不純物の分析法と化学物質の取り扱い
騰川博之、大久保貴史、野中祐美、山口卓男、小比賀聡、川上純司（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 核酸医薬品の不純物の分析）
技術情報協会 2024年1月 （ ISBN:978-4-86104-998-9 ）
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核酸医薬品のCMC管理戦略 −品質評価・不純物管理−
冨田恵麗沙, 秋田智香, 川上純司（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 核酸医薬品と核酸化学）
サイエンス&テクノロジー 2022年9月 （ ISBN:9784864282925 ）
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核酸科学ハンドブック
川上純司（ 担当： 分担執筆 , 範囲: アンチセンス核酸のメカニズム）
講談社 2020年12月 （ ISBN:9784065207864 ）
総説・解説記事（Misc） 【 表示 ／ 非表示 】
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核酸医療の基礎知識 修飾核酸 招待あり
秋田 智香、冨田 恵麗沙、川上 純司
月刊 臨床神経科学 41 ( 5 ) 639 - 642 2023年5月
掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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日本発の核酸医薬を世界に向けて
川上純司
SCAS NEWS 2023-1 1 - 2 2023年
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LC/MSを使用したオリゴ核酸の不純物分析
瀬崎浩史、内藤厚子、林明生、川上純司、井上貴雄、山口卓男、小比賀聡
Medical Science Digest 49 ( 14 ) 780 - 782 2023年
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製造委託の際に知っておきたい核酸医薬の特性ー品質と安全性評価面を中心に 招待あり
川上 純司
Pharm Tech Japan 38 ( 12 ) 2017 - 2022 2022年9月
掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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核酸医薬の化学 総論 −修飾核酸と機能評価
秋田智香、川上純司
実験医学 39 ( 17 ) 2716 - 2722 2021年
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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The development of continuous purification process for oligonucleotides purification and its potential benefits
Cheng-Linn Lee, Mayuko Mouri, Kengo Kashio, Kiyotaka Takimoto, Junji Kawakami, Takao Inoue, Satoshi Obika, Eigo Muto
XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024年9月
開催年月日： 2024年9月
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Stability and structural analysis of DNA/RNA heteroduplexes containing a bulge
Tomoka Akita, Taiichi Sakamoto, Elisa Tomita-Sudo, Renshin Sano, Nae Sakimoto, Junji Kawakami
XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024年9月
開催年月日： 2024年9月
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p53機能欠損が惹起する異常な核小体ストレス応答の解明
取井猛流、本間美和子、川上純司、三好大輔、川内敬子
2024年度文部科学省学術変革領域研究先端モデル動物支援プラットフォーム若手支援技術講習会 2024年8月
開催年月日： 2024年8月
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rRNA量の低下が引き起こす核小体構造変化におけるG-quadruplexの働き
取井猛流、月生雅也、平田宏聡、川上純司、村嶋貴之、三好大輔、川内敬子
2024年度文部科学省学術変革領域研究先端モデル動物支援プラットフォーム若手支援技術講習会 2024年8月
開催年月日： 2024年8月
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連続クロマトグラフィー（MCSGP）を用いたオリゴ核酸の精製（第二報）
加塩健悟、毛利真裕子、瀧本清貴、川上純司、井上貴雄、小比賀聡、武藤英吾
日本核酸医薬学会第9回年会 2024年7月
開催年月日： 2024年7月
科研費（文科省・学振）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
2004年4月 - 2006年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)
ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
領域・整理
・課題番号
4706
7305
16750150 -
ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
2004年4月 - 2006年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)
ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
領域・整理
・課題番号
4706
7305
16750150 -
ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
2004年4月 - 2006年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 若手研究(B)
ヘアピンループＤＮＡ／ＲＮＡを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価
領域・整理
・課題番号
4706
7305
16750150
研究費にかかる研究（調査）活動報告書 【 表示 ／ 非表示 】
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2022年度 核酸医薬、RNA工学、遺伝子工学 アンチセンス核酸医薬の薬効予測法の開発
研究費の種類： その他
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2021年度 核酸医薬、RNA工学、遺伝子工学 アンチセンス核酸医薬の薬効予測法の開発
研究費の種類： その他
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2020年度 核酸医薬、RNA工学、遺伝子工学 アンチセンス核酸医薬の薬効予測法の開発
研究費の種類： その他
その他教育活動及び特記事項 【 表示 ／ 非表示 】
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2009年4月-現在
ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース① 実験の基本と原理
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2009年4月-現在
ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース② 実習編
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2009年4月-現在
ゼロからはじめるバイオ実験マスターコース③ 細胞培養トレーニング
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2019年7月
ベストレクチャー研修会
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2014年12月
FDワークショップ「Reflective Teaching - Understanding why we do what we do in the classroom?」
所属学協会等の委員歴 【 表示 ／ 非表示 】
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2015年4月 - 現在 日本核酸医薬学会 評議員、幹事、事務局
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2004年4月 - 2017年3月 高分子学会 バイオ・高分子研究会 運営委員
社会貢献活動 【 表示 ／ 非表示 】
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出張模擬講義
2014年12月
毒学 - 薬学へのいざない／兵庫県立舞子高等学校
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模擬講義
2014年12月
毒学／兵庫大学附属須磨ノ浦高等学校
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サイエンスパートナーシッププロジェクト
2014年8月
自然科学入門講座「身近な生活から最先端の遺伝子研究について学ぶ」- 遺伝子鑑定／兵庫県立星陵高等学校
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etc
2014年3月
遺伝子鑑定の精度・信憑性／兵庫県警察本部 刑事部
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模擬講義
2013年12月
くすりの科学／須磨ノ浦女子高等学校
提供可能な資源 【 表示 ／ 非表示 】
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生体高分子の合成・精製
生体高分子の合成・精製
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原核生物を用いたバイオテクノロジー
原核生物を用いたバイオテクノロジー
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分子間相互作用解析
分子間相互作用解析