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SUGIMOTO Naoki

Position

Professor

External Link

Graduating School 【 display / non-display

  • Kyoto University   Faculty of Science   Graduated

    - 1979.3

Graduate School 【 display / non-display

  • Kyoto University   Graduate School, Division of Natural Science   Doctor's Course   Completed

    - 1985.3

  • Kyoto University   Graduate School, Division of Natural Science   Master's Course   Completed

    - 1982.3

Campus Career 【 display / non-display

  • KONAN UNIVERSITY   Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology   Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry   Professor

    2009.4

  • KONAN UNIVERSITY   Frontier of Institute for Biomolecular Engineering Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry   Director in General

    2004.4

  •   ハイテクリサーチセンター   所長

    2001.4 - 2004.3

  • KONAN UNIVERSITY   Faculty of Science   Professor

    1994.4 - 2009.3

  • KONAN UNIVERSITY   Faculty of Science   Associate Professor (as old post name)

    1991.4 - 1994.3

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External Career 【 display / non-display

  • 学校法人 甲南学園

    2012.8

      More details

    Country:Japan

  • ロチェスター大学

    1985.4 - 1988.3

      More details

    Country:United States

 

Papers 【 display / non-display

  • DNA methylation is regulated by both the stability and topology of G-quadruplex

    S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

    Chem. Commun.,   58   12459 - 12462   2022.10

  • Volumetric strategy for quantitatively elucidating local hydration network around a G-quadruplex International coauthorship

    S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama, and N. Sugimoto

    Anal. Chem   94 ( Selected as a Supplemental Cover )   7400 - 7407   2022.5

     More details

    Authorship:Last author  

    DOI: 10.1021/acs.analchem.2c01075

  • Applicability of Nearest-neighbour Model for Pseudoknot RNAs International coauthorship

    S. Satpathi, T. Endoh, and N. Sugimoto

    Chem. Commun   58 ( [Selected as an Inside Back Cover] )   5952 - 5955   2022.4

     More details

    Authorship:Last author  

    DOI: 10.1039/d1cc07094k

  • Replication Control of Human Telomere G-Quadruplex DNA by G-Quadruplex Ligands Dependent on Solution Environment International coauthorship

    S. Takahashi, S. Bhowmik, S. Sato, S. Takenaka, and N. Sugimoto

    Life   12 ( 4 )   553   2022.4

     More details

    Authorship:Last author  

    DOI: 10.3390/life12040553

  • 細胞内での核酸の挙動を明らかにする熱力学的解析

    高橋俊太郎, 杉本 直己

    熱測定   49   14 - 19   2022.1

     More details

    Joint Work

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Books and Other Publications 【 display / non-display

  • Chemistry and Biology of Non-canonical Nucleic Acids

    N. Sugimoto( Role: Sole author)

    WILEY  2021.4 

  • 核酸科学ハンドブック

    杉本 直己( Role: Edit)

    講談社  2020.12 

  • 第Ⅳ部 生物学的相分離の理論

    建石 寿枝, 杉本 直己( Role: Joint author)

    相分離生物学の全貌(現代化学増刊46)(東京化学同人)  2020.11 

  • Quantitative Analysis of Stall of Replicating DNA Polymerase by G-Quadruplex Formation

    S. Takahashi and N. Sugimoto( Role: Joint author)

    Methods in Molecular Biology (Methods Mol. Biol.)Springer  2019 

  • Development and Application of a Highly Efficient Protein Synthesis Technique Using Riboswitches in Microorganisms

    T. Yamauchi, N. Sugimoto( Role: Joint author)

    Applied RNA Bioscience (Springer)  2018.4 

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Review Papers (Misc) 【 display / non-display

  • 遺伝子発現における核酸の新機能 Reviewed

    松本咲, 杉本直己

    CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学―ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬―」   41   146 - 154   2021.10

  • 細胞内の核酸物理化学 Reviewed

    高橋俊太郎, 杉本直己

    CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学―ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬―」   41   14 - 21   2021.10

  • がん関連mRNAと光線力学療法

    三好大輔, 杉本直己

    CSJカレントレビュー「生体分子と疾患」   39   75 - 83   2021.8

     More details

    Publisher:化学同人  

  • Roles of non-canonical structures of nucleic acids in cancer and neurodegenerative diseases Invited Reviewed

    H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

    Nucleic Acids Res.,   49   7839 - 7855   2021.7

     More details

  • Functions of nucleic acids regulated by molecular crowding and their contributions to disease pathogenesis Reviewed

    53 ( 6 )   4 - 7   2021.4

     More details

    Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

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Presentations 【 display / non-display

  • Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (78) : Analysis of structural dynamics of c-Myc G-quadruplex DNA using high pressure

    S. Takahashi, T. Ohyama, S.-B. Chen, J.-H. Tan, N. Sugimoto

    第102回春季年会  日本化学会

     More details

    Event date: 2022.3

  • 脱ワトソン・クリックの核酸化学 (77):高圧環境がDNA非二重らせん構造に与える影響

    大山 達也,高橋 俊太郎,建石 寿枝,田中 成典,杉本 直己

    第102回春季年会  (オンライン)  日本化学会

     More details

    Event date: 2022.3

  • Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (75): Development of RNA-ligand pairs for multicolor RNA imaging in cells

    T. Endoh, Jia-Heng Tan, Shuo-Bin Chen, N. Sugimoto

    第102回春季年会  (オンライン)  日本化学会

     More details

    Event date: 2022.3

  • Structure-based Derivatization of Berberine to Improve the Potency for Targeting RNA Structures

    S. Satpathi, T. Endoh, Yutong Chen, S. Matsumoto, T. Ohyama, P. Podbevšek, J. Plavec, K. Onizuka, F. Nagatsugi, N. Sugimoto

    第102回春季年会  (オンライン)  日本化学会

     More details

    Event date: 2022.3

  • Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (74): Effect of DNA modifications on the transition between canonical and non-canonical DNA structures in CpG island

    S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, N. Sugimoto

    第102回春季年会  (オンライン)  日本化学会

     More details

    Event date: 2022.3

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Other Research Activities 【 display / non-display

  • 私の自慢「知の系譜:挑戦するオストワルト・ギブスの末裔たち-物理化学は細胞の中へ,極限状態の生命へ」

    2013.2

     More details

    Book Review

Academic Awards Received 【 display / non-display

  • 第72回日本化学会賞

    2020.3   公益社団法人日本化学会   分子クラウディング環境における非二重らせん核酸の化学

    杉本直己

  • The Imbach-Townsend Award

    2018.8   IS3NA(International Society for Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids)  

    N. Sugimoto

  • Keynote Lecture賞

    2016.6   European Chemistry Congress (Euro Chemistry2016)  

    Naoki Sugimoto

  • 第39回井植文化賞(科学技術部門)

    2015.10   公益財団法人 井植記念会  

    杉本直己

  • 平成26年度 錯体化学会 貢献賞

    2014.9   錯体化学会  

    杉本 直己

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Grant-in-Aid for Scientific Research 【 display / non-display

  • いつ、どこで、どのように、核酸の高次構造は形成し機能するのかを予測する

    2022.4 - 2027.3

    JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research(S)

      More details

    Authorship:Principal investigator

  • イオンチャンネルは核酸の非二重らせん構造の形成と遺伝子発現を制御しているのか

    2020.7 - 2022.3

    JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

      More details

    イオンチャンネルは核酸の非二重らせん構造の形成と遺伝子発現を制御しているのか

  • 核小体内クラウディング環境におけるリボソームRNA形成の定量的解析

    2019.11 - 2022.3

    JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for JSPS Fellows

      More details

    核小体内クラウディング環境におけるリボソームRNA形成の定量的解析

  • 核酸構造のトポロジーによる遺伝子発現の化学的制御

    2019.4 - 2022.3

    JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research(A)

    杉本 直己

      More details

    核酸構造のトポロジーによる遺伝子発現の化学的制御

  • 核酸の非二重らせん構造を調節し、がんの発症を制御するのは、カリウムイオンなのか

    2018.4 - 2020.3

    JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

      More details

    核酸の非二重らせん構造を調節し、がんの発症を制御するのは、カリウムイオンなのか

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Other External funds procured 【 display / non-display

  • 核酸の非標準構造を標的とした細胞応答の化学的制御技術の構築と先制核酸医

    2014.4 - 2019.3

    文部科学省  文部科学省私立大学戦略的研究基盤形成支援事業

  • 特異なmRNA構造を活用した翻訳フレームシフト及び産生タンパク質機能の制御

    2013.4 - 2014.3

    公益財団法人長瀬科学技術振興財団  長瀬科学技術振興財団助成金

  • ひらめき☆ときめき サイエンス~要こそ大学の研究室~KAKENHI

    2011.4 - 2012.3

    文部科学省  「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業

  • 生命化学分野に関する学術動向の調査研究

    2011.4 - 2012.3

    文部科学省  学術システム研究センター研究員

  • ひらめき☆ときめき サイエンス~要こそ大学の研究室~KAKENHI

    2010.4 - 2011.3

    文部科学省  「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業

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Joint and Contract research activities (Public) 【 display / non-display

  • フタロシアニンなどのπ共役化合物による細胞毒性検討および癌関連酵素の新規測定技術の開発

    Domestic Joint Research

    2011.4 - 2012.3

  • 平成23年度調査研究「生命科学分野に関する学術動向の調査研究」

    General funded research

    2011.4 - 2012.3

  • DNAの高次構造に注目した細胞のがん化機構の解明と化学物質のリスク評価システムの構築

    General funded research

    2010.9 - 2011.8

  • フタロシアニンなどのπ共役化合物の抗腫瘍効果の検討および生体センシングへの応用検討

    Joint Research on Campus

    2010.4 - 2011.3

  • DNAの高次構造に注目した細胞のがん化機構の解明と化学物質のリスク評価システムの構築

    General funded research

    2009.9 - 2010.8

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Preferred joint research theme 【 display / non-display

  • 生命分子(核酸・タンパク質等)の立体構造の解明

  • 生命分子間相互作用のデータベース化

  • 生命分子(核酸・タンパク質等)の物性解析

 

Committee Memberships 【 display / non-display

  • 2017.11 - 2020.8   日本核酸化学会  会長

  • 2015.5 - 2017.5   日本化学会  理事

  • 2013.3 - 2015.2   日本化学会  生体機能関連部会監事

  • 2011.3 - 2013.2   日本化学会  生体機能関連部会部会長

  • 2010.4 - 2017.3   社団法人 日本学術振興会  学術システム研究センター専門研究員

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Social Activities 【 display / non-display

  • ひょうご経済・雇用活性化プラン策定会議構成員

    2018.6 - 2019.3

  • ひょうご次世代産業高度化プロジェクト推進協議会委員

    2018.4 - 2021.3

  • 南開大学客座教授

    2017.3

  • 兵庫県ひょうご経済・雇用活性化プラン推進会議構成員

    2016.7 - 2017.3

  • 月刊『化学』編集委員会委員

    2016.4

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