教員・研究者詳細 - 杉本　直己

講演・口頭発表等 - 杉本　直己

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Construction of artificial viral capsid encapsulating quadruplex DNA and its intracellular delivery

K. Matsuura, M. Ishii, H. Inaba, T. Endoh, H. Tateshi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (20) : G-quadruplex DNA formations depending on the environments in the mitochondrial matrix

L. Liu, S. Takahashi, G. Sarptarshi, T. Endoh, N. Yoshinaga, K. Numata, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (19): ATP regulates the DNA stability through structure-dependent cation exchange

S. Das, S. Takahashi, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (18) : Comparison of the stability of DNA duplexes among normal and cancer cells

K. Chen, H. Tateishi-Karimata, S. Takahashi, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids (17): Development of a pseudo-cellular system with different molecular crowding environments

M. Takatsu, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (16) : Cellular compartment size as a critical factor in the stability and function of nucleic acids

S. Sarkar, H. Tateishi-Karimata, K. Matsuura, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (15): Universal prediction of DNAzyme activity using new nearest neighbor parameters and AI

S.Takahashi, T. Nishimura, S. Ghosh, H. Tateishi-Karimata, T. Fukunaga, M. Hamada, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (14), Development of methods to predict RNA secondary structures in cells

H. Tateishi-Karimata, D. Banerjee, S. Takahashi, T. Nishimura, T. Fukunaga, M. Hamada, M. Orehova, J. Plavec, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (13): Global and local molecular crowding effects depending on the size of crowding cosolute on stability of pseudoknot RNA

T. Endoh, S. Satpathi, N. Sugimoto

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (12) : Role of groove hydration on stability and functions of biased DNA duplexes

N. Sugimoto, S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, L. Liu

日本化学会第105回春季年会

開催年月日： 2025年3月

Predictability of environment-dependent formation of the behavior of DNAs in human mitochondria

S. Takahashi, L. Liu, S. Ghosh, T. Endoh, N. Yoshinaga, K. Numata and N. Sugimoto

To B or Not to B Symposium 2025

開催年月日： 2025年3月

Quantify specific interactions determining G-quadruplex and i-motif formation during cancer progression

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, S. Takahashi, and N. Sugimoto

To B or Not to B Symposium 2025

開催年月日： 2025年3月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Department of Pharmacy, University of Naples Federico II (Naples) 2025年2月 University of Naples “Federico II”

開催年月日： 2025年2月

国名：イタリア共和国

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures.1-12 I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated. I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of intracellular analysis and stability prediction are discussed for the application of NN parameters for human health and diseases.

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Department of Molecular Medicine of the University of Padua (Padua) 2025年1月 University of Padua

開催年月日： 2025年1月

国名：イタリア共和国

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and pplications of predicting the stabilities of nucleic acid structures.1-12 I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated. I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally,studies of ntracellular analysis and stability prediction are discussed for the application of NN parameters for human health and diseases.

All about “To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The 7th Asian Chemical Biology Conference 2025 (ACBC) (Kowloon) 2025年1月 The Hong Kong University of Science and Technology

開催年月日： 2025年1月

国名：ホンコン(香港)特別行政区

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures.1-11 I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated. I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of intracellular analysis and stability prediction are discussed for the application of NN parameters for human health and diseases.

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

Special Departmental Seminar of Chemistry Department of City University of Hong Kong (Kowloon) 2025年1月 City University of Hong Kong

開催年月日： 2025年1月

国名：ホンコン(香港)特別行政区

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures.1-11 I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated. I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of intracellular analysis and stability prediction are discussed for the application of NN parameters for human health and diseases.

"To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

the 11th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (Guilin) 2024年12月 Asian Bioinorganic Chemistry Steering Committee

開催年月日： 2024年12月

国名：中華人民共和国

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures. I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated.1-6 I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of ligands binding to canonical and non-canonical structures of nucleic acids are discussed for human health and diseases.

神経変性疾患に関わる核酸の周辺環境に依存した構造解析とその制御, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡

建石寿枝, 杉本直己

第50回日本分子生物学会年会

開催年月日： 2024年11月

To B Or Not To B” In Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

Solutions in Chemistry 2024 (Sveti Martin na Muri) 2024年11月 The Croatian Chemical Society

開催年月日： 2024年11月

国名：クロアチア共和国

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures. I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated.1-6 I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of ligands binding to canonical and non-canonical structures of nucleic acids are discussed for human health and diseases.

Beyond the Watson-Crick Double Helix: Make New History of Nucleic Acids (9) 招待あり

N. Sugimoto

Asia 3 Roundtable on Nucleic Acids 2024 (Busan) 2024年11月 A3RONA 2024 Organizing Committee

開催年月日： 2024年11月

国名：大韓民国

Nucleic acids (DNA and RNA) are genetic materials in living organisms and formed by a sequence of nucleobases. The stability of nucleic acids structures cannot be determined from only the sequence composition, as this property critically depends on the surrounding environment of the solution. The intracellular condition is greatly different from that of the diluted buffer typically used for standard experiments and is not constant in each local area of the cell. Thus, to make excellent nanomaterials with nucleic acids working in cells, stability predictions should reflect the situation under intracellular conditions and are required importantly. In this lecture, I will provide an overview of the basic concepts, methods, and applications of predicting the stabilities of nucleic acid structures. I explain the theory of the most successful prediction method based on a nearest-neighbor (NN) model. To improve the versality of prediction, corrections for various solution conditions considered hydration have been investigated. I also describe advances in the prediction of non-canonical structures of G-quadruplexes and i-motifs. Finally, studies of intracellular analysis and stability prediction are discussed for the application of NN parameters for human health and diseases.

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Bioanalytical Chemistry Department, Faculty of Chemistry (Poznan) 2024年10月 Adam Mickiewicz University

開催年月日： 2024年10月

国名：ポーランド共和国

Nearest-neighbor parameters with AI beyond experiments: Prediction of RNA secondary structures containing mismatches

H. Tateishi-Karimata, B. Dipanwita, S. Takahashi, T. Fukunaga, M. Hamada, N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids “ANNA2024”

開催年月日： 2024年10月

Nearest-neighbor parameters meet AI: Functional prediction of DNAzyme

S. Takahashi, S. Ghosh, H. Tateishi-Karimata, T, Fukunaga, M. Hamada, N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids “ANNA2024”

開催年月日： 2024年10月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

Giants and Forerunners in Nucleic Acid Chemistry (Ljubljana) 2024年10月 the Slovenian Academy of Sciences and Arts

開催年月日： 2024年10月

国名：スロベニア共和国

Quantitative Investigation of i-Motif Structures in the CDH1 Gene Under pH and Potassium Ion Fluctuation

K. Chen, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第15回日本女性科学者の会学術大会

開催年月日： 2024年10月

細胞内核酸の安定性と機能を予測・決定するための重要因子を明らかにする疑似細胞システム

建石寿枝, 高橋俊太郎, 杉本直己

第73回高分子討論会

開催年月日： 2024年9月

RNA複製酵素の精密性に及ぼす分子環境の効果

高橋俊太郎, 建石寿枝, 杉本直己

第73回高分子討論会

開催年月日： 2024年9月

RNA複製エラーを引き起こす非ワトソン−クリック型塩基対形成

高橋俊太郎, 建石寿枝, 杉本直己

第18回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2024年9月

擬似細胞システムを使った細胞内の四重らせん構造の解析

建石寿枝, 高橋俊太郎, 川内敬子, Chen Kun, 凌一葦, 奥田修二郎, 遠藤玉樹, 杉本直己

第18回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2024年9月

分子クラウディング環境に応答するグアニン四重鎖形成領域のゲノムワイドスクリーニング

遠藤玉樹, 奥田修二郎, 凌一葦, 建石寿枝, 杉本直己

第18回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2024年9月

四重鎖DNAを内包した人工ウイルスキャプシドの創製, つくば国際会議場

石井楽乃, 稲葉央, 遠藤玉樹, 建石寿枝, 杉本直己, 松浦和則

第18回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2024年9月

In Cell Statistical Thermodynamics for Analyzing and Controlling Functions of Nucleic Acids 招待あり

N. Sugimoto

Post-symposium of XXV International Roundtable of Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024年9月

開催年月日： 2024年9月

国名：日本国

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) (Katsushika Campus,Tokyo University of Science) 2024年9月 The Japan Society of Nucleic Acids Chemistry

開催年月日： 2024年9月

国名：日本国

Interactions between fluorogens and i-motif DNAs depending on loop sequences

T. Endoh, S. Das, S. Takahashi, J. Tan, S. Chen, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

Twisting of helicity induces diverse functionality of i-motif DNA

S. Takahashi, S. Ghosh, M. Trajkovski, T. Ohyama, J. Plavec, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

Quantify specific interactions determining G-quadruplex function during cancer progression using a pseudo-cellular system

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, S. Takahashi, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

Gene regulatory mechanisms of imperfect G-quadruplexes with bulges

S. Sarkar, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

Quantitative analysis of i-motif and G-quadruplex structures on CDH1 gene under pH and K+ variations

K. Chen, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

ATP-mediated regulation of stability and function of i-motif DNA

S. Das, S. Takahashi, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

Elucidating the Role of Groove Hydration on Stability and Functions of Biased DNA Duplexes in Cell-Like Chemical Environments

L. Liu, S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, N. Sugimoto

XXV International Roundtable of Nucleosides

開催年月日： 2024年9月

“To B or not to B” in Nanotechnology of Nucleic Acids 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of School of Pharmacy (London) 2024年7月 Univesity of College London, School of Pharmacy

開催年月日： 2024年7月

国名：グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国)

Quantitative analysis for quadruplex functions regulated by ligand binding 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of School of Pharmacy (London) 2024年7月 Univesity of College London, School of Pharmacy

開催年月日： 2024年7月

国名：グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国)

“To B or not to B" in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Institute of Elemento-organic Chemistry (Tianjin) 2024年7月 The State Key Laboratory of Elemento-organic Chemistry of Nankai University

開催年月日： 2024年7月

国名：中華人民共和国

“To B or not to B”in Nanotechnology of Nucleic Acids 招待あり

N. Sugimoto

11th International Conference on DNA Nanotechnology (Sainan) 2024年7月 The School of Chemistry & Chemical Engineering and Materials Science at Shandong Normal University

開催年月日： 2024年7月

国名：中華人民共和国

Role of Bulge-Containing G-Quadruplexes in Transcriptional Regulation, London, The Royal Society of Chemistry

S. Sarkar, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, N. Sugimoto

20th RSC Nucleic Acids Forum

開催年月日： 2024年7月

Development of pseudo-cellular systems to understand effects of molecular environments on G-quadruplex behaviors in cells

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, S. Takahashi, N. Sugimoto

20th RSC Nucleic Acids Forum

開催年月日： 2024年7月

Regulation of gene expression regulated by nucleic acid structures, University of Reading

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

Seminar in University of Reading

開催年月日： 2024年7月

“To B or not to B" in Nucleic Acids Chemistry 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Department of Bioorganic Chemistry (Poznan) 2024年6月 Poznan branch of the Polish Academy of Science

開催年月日： 2024年6月

国名：ポーランド共和国

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry, “Basic Physical Chemistry of Nucleic Acids”, “Applied Physical Chemistry of Nucleic Acids" 招待あり

N. Sugimoto

The Seminar of Department of Bioorganic Chemistry, Centre of Molecular and Macromolecular Studies, the Polish Academy of Sciences (Lodz) 2024年6月 Centre of Molecular and Macromolecular Studies of the Polish Academy of Sciences

開催年月日： 2024年6月

国名：ポーランド共和国

The nearest-neighbor parameters for DNA duplexes in living cell-mimicked system reveal unique changes in cation-DNA interactions in living cells

K. Chen, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

開催年月日： 2023年7月

シトシン四重らせん構造によるがん遺伝子発現の制御

建石寿枝、川内敬子、杉本直己

日本核酸医薬学会第8回年会 (名古屋大学豊田講堂)

開催年月日： 2023年7月

新型コロナウイルスのRNA依存性RNAポリメラーゼ活性を抑制できるヒト内在性RNAの取得

遠藤玉樹、高橋俊太郎、杉本直己

日本核酸医薬学会第8回年会 (名古屋大学豊田講堂)

開催年月日： 2023年7月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Research 招待あり

N. Sugimoto

Nucleic Acids; Prospect and Therapeutic Applications (National Chung Hsing University)

開催年月日： 2023年7月

国名：台湾

Prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions

N. Sugimoto

Gordon Research Conference (Nucleosides, Nucleotides and Oligonucleotides) (Salve Regina University)

開催年月日： 2023年6月

国名：アメリカ合衆国

“To B or not to B” in Nucleic Acid Therapeutics 招待あり

N. Sugimoto

Sungkyunkwan University Nucleic Acid Forum (SKKU NAF 2023) (Sungkyunkwan University)

開催年月日： 2023年6月

国名：大韓民国

“To B or not to B” in Nucleic Acids Research 招待あり

N. Sugimoto

The 6th Conference on Frontiers in Water Biophysics (FWB)

開催年月日： 2023年5月

国名：イタリア共和国

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (81) : Stability prediction of RNA duplexes under various molecular crowding in vitro and in cell

S. Ghosh, S. Takahashi, D. Banerjee, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

エピジェネティック修飾のメチル化はDNAグアニン四重鎖とアルギニンリッチなペプチドによる液滴形成を抑制する

鶴田充生, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (88): がん細胞内環境変化に応答したC四重らせん構造の形成機構の解明

建石寿枝, 川内敬子, 杉本直己

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (87): 高圧力を用いたグアニン四重鎖の水和解析によるリガンド結合予測

高橋俊太郎, 松本咲, 大山達也, S. Bhowmik, 杉本直己

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (86): シグナリングライトアップアプタマーによる同一細胞内における複数化合物の多色検出

遠藤玉樹, J.-H. Tan, S.-B. Chen, 杉本直己

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (85): G4C2 繰り返し配列をもつ RNA 四重鎖とジペプチドの集積メカニズムの解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (84) : Fluorescence light-up through binding of dye molecules to specific loop sequences of i-motif DNA

S. Das, S. Takahashi, N. Sugimoto

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (83) : Bulge-containing G-quadruplexes is a new target motif to regulate gene expression in therapeutics

S. Sarkar, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (82) : Applications of nearest-neighbor parameters for RNA/DNA hybrid duplexes in the advancement of therapeutics

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, M. Toplishek, M. Trajkovski, J. Plavec, N. Sugimoto

日本化学会第103回春季年会 (東京理科大学野田キャンパス)

開催年月日： 2023年3月

天然アルカロイド化合物の化学的拡張によるRNA機能制御分子の開発

遠藤玉樹、S. Satpathi、Y. Chen、松本咲、大山達也、P. Podbevšek、J. Plavec、鬼塚和光、永次史、杉本直己

第22回東北大学多元物質科学研究所研究発表会 (東北大学片平さくらホール（オンライン参加）)

開催年月日： 2022年12月

グアニン四重らせん構造による転移因子 LINE–1 の発現抑制

月生雅也, 李先民, B. Y. Suryani, 鶴田充生, 橋本佳樹, 高宮渚, 木下菜月, 建石寿枝, 杉本直己, 三好大輔, 川内敬子

第14回日本女性科学者の会(SJWS)学術会議 (オンライン開催)

開催年月日： 2022年12月

核小体LLPSにおけるrDNA由来G-quadruplexの役割

取井猛流、杉本渉、建石寿枝、木下菜月、鶴田充生、月生雅也、村嶋貴之、西方敬人、杉本直己、三好大輔、川内敬子

第45回日本分子生物学会年会 (幕張メッセ)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

ホヤ卵の胚軸形成におけるRNAのG-quadruplex（G4）の局在

鳥居柊平、後藤俊志、建石寿枝、杉本直己、西方敬人

第45回日本分子生物学会年会 (幕張メッセ)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

液-液相分子により形成されるグアニン四重らせん構造集合体の役割

川内敬子、取井猛流、谷口慎也、木下菜月、建石寿枝、杉本直己、三好大輔

第45回日本分子生物学会年会 (幕張メッセ)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

グアニン四重らせん構造による転移因子LINE-1の発現制御

李先民, 月生雅也, B. Y. Suryani, 木下菜月, 谷口慎也, 橋本佳樹, 建石寿枝, 杉本直己, 三好大輔, 川内敬子

第45回日本分子生物学会年会 (幕張メッセ)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

Energetic and volumetric strategy to design ligands binding to DNA G-quadruplexes

S. Takahashi and N. Sugimoto

10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10) (神戸国際会議場)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

Quantitative analysis of metal ion and hydration on the DNA duplex stability

S. Ghosh, S. Takahashi, and N. Sugimoto

10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10) (神戸国際会議場)

開催年月日： 2022年11月 - 2022年12月

環境応答性を示す非二重らせん核酸構造のスクリーニング法の構築

遠藤玉樹, 奥田修二郎, 凌一葦, 建石寿枝, 杉本直己

第95回日本生化学会大会 (名古屋国際会議場)

開催年月日： 2022年11月

分子シミュレーションを用いた高圧環境における核酸の安定性の解析

大山達也、高橋俊太郎、建石寿枝、田中成典、杉本直己

核酸化学若手フォーラム2022 (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Thermodynamics approach for the fidelity of RNA-dependent RNA polymerase of SARS- CoV-2 under molecular crowdings

S. Takahashi, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Quantitative analysis for G-quadruplex and i-motif formations in malignant cancers

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Fluorometric detection of multiple small molecules using orthogonal light-up signaling aptamers in cells

T. Endoh, J.-H. Tan, S.-B. Chen, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Crystallographic studies of ruthenium polypyridyl complexes bound to G-quadruplexes: Towards design, specificity, and function

K. McQuaid, D. Cardin, J. Hall, N. Paterson, S. Takahashi, N. Sugimoto, C. Cardin

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

New parameters for accurate prediction of RNA/DNA hybrid duplex stability and their advantage in CRISPR- Cas9 technique

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, S. Ghosh, T. Endoh, S. Takahashi, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Prediction of RNA duplex stability in physiological crowding conditions based on the nearest-neighbor model

S. Ghosh, S. Takahashi, D. Banerjee, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

The effect of stability and topology of G-quadruplex on DNA methylation

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第49回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学葛飾キャンパス)

開催年月日： 2022年11月

Analysis of dynamic behaviors of G-quadruplexes using molecular simulations

T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, S. Takahashi, S. Tanaka, N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2022 “ANNA2022” (Ljubljana Castle, Slovenia)

開催年月日： 2022年10月

Beyond "To B or not to B" in Nucleic Acids Chemistry

N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2022 “ANNA2022” (Ljubljana Castle, Slovenia)

開催年月日： 2022年10月

DNA methylation depending on stability and topology of G-quadruplex

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2022 “ANNA2022” (Ljubljana Castle, Slovenia)

開催年月日： 2022年10月

細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子の設計指針

杉本直己、三好大輔、建石寿枝

分子夾雑の生命化学　成果とりまとめ公開シンポジム (福岡アイランドシティフォーラム　カンファレンスルーム)

開催年月日： 2022年9月

SARS-CoV-2由来RNA依存性RNAポリメラーゼの複製反応におけるグアニン四重鎖の効果とその制御

高橋俊太郎, 松本咲, 建石寿枝, B. H. Kim, 杉本直己

第16回バイオ関連化学シンポジウム (名古屋大学東山キャンパス)

開催年月日： 2022年9月

RNAシュードノット構造の安定性予測のための最近接塩基対モデルの検証

遠藤玉樹, S. Satpathi, 杉本直己

第16回バイオ関連化学シンポジウム (名古屋大学東山キャンパス)

開催年月日： 2022年9月

神経変性疾患に関わるリピートRNAとペプチドの相互作用解析

建石寿枝, 大山達也, 田中成典, 杉本直己

第16回バイオ関連化学シンポジウム (名古屋大学東山キャンパス)

開催年月日： 2022年9月

グアニン四重らせん構造の安定性とトポロジーによるDNAメチル化制御

松本咲, 建石寿枝, 杉本直己,

第16回バイオ関連化学シンポジウム (名古屋大学東山キャンパス)

開催年月日： 2022年9月

i-motif 型 DNA 構造に対する分子クラウディング効果の定量的解析

高橋俊太郎, S. Ghosh, P. Chilka, 大山達也, 杉本直己

第71回高分子討論会 (北海道大学札幌キャンパス)

開催年月日： 2022年9月

Nucleotides and Nucleic Acids: Prediction of structure and stability of nucleic acids under molecular crowding: To B or not to B

N. Sugimoto

XXIV International Round Table on Nucleosisdes (Stockholm, Sweden)

開催年月日： 2022年8月

Functions of nucleic acids regulated by the intracellular molecular environments

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

India|EMBO Lecture Course: Functional nucleic acids: Recent landscapes and therapeutic applications (Regional Centre for Biotechnology, India, (オンライン参加))

開催年月日： 2022年8月

Role of macromolecular crowding in the cells on the structures and functions of nucleic acids

N. Sugimoto

India|EMBO Lecture Course: Functional nucleic acids: Recent landscapes and therapeutic applications (Regional Centre for Biotechnology, India, (オンライン参加))

開催年月日： 2022年8月

核酸構造の定量的解析を基にしたC9orf72由来のリピートRNAとペプチドの相互作用制御法の開発

建石寿枝, 松本咲, 大山達也, Ye Teng, 田中成典, 杉本直己

日本核酸医薬学会第7回年会 (御茶ノ水ソラシティカンファレンスセンター)

開催年月日： 2022年7月 - 2022年8月

researchmap

Adventures of Non-Double Helical Nucleic Acids in Molecular Crowding World 招待あり

N. Sugimoto

8th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids (Marienbad, Marienbad, Czech Republic)

開催年月日： 2022年6月 - 2022年7月

researchmap

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (78) : Analysis of structural dynamics of c-Myc G-quadruplex DNA using high pressure

S. Takahashi, T. Ohyama, S.-B. Chen, J.-H. Tan, N. Sugimoto

第102回春季年会日本化学会

開催年月日： 2022年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (77):高圧環境がDNA非二重らせん構造に与える影響

大山達也,高橋俊太郎,建石寿枝,田中成典,杉本直己

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (75): Development of RNA-ligand pairs for multicolor RNA imaging in cells

T. Endoh, Jia-Heng Tan, Shuo-Bin Chen, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Structure-based Derivatization of Berberine to Improve the Potency for Targeting RNA Structures

S. Satpathi, T. Endoh, Yutong Chen, S. Matsumoto, T. Ohyama, P. Podbevšek, J. Plavec, K. Onizuka, F. Nagatsugi, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (74): Effect of DNA modifications on the transition between canonical and non-canonical DNA structures in CpG island

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (73):Effect of G-quadruplex stability change on transcriptional repression in cancer cells

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, T. Ohyama, H. Masaki, A. Natsume, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (76) : Structure-based Derivatization of Berberine to Improve the Potency for Targeting RNA Structures

S. Satpathi, T. Endoh, Y. Chen, S. Matsumoto, T. Ohyama, P. Podbevšek, J. Plavec, K. Onizuka, F. Nagatsugi, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (79) : Application of the nearest-neighbor model for the stability prediction of intramolecular i-motif DNAs

P. Chilka, S. Takahashi, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (80) : Validation of the nearest-neighbor model for Watson-Crick RNA duplexes under molecular crowding condition

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, N. Sugimoto

第102回春季年会 (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2022年3月

Effect of DNA modifications on the changes of DNA structure in CpG islands

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, O. Tatsuya, N. Sugimoto

International Conference on Chemical and Environmental Sciences 2021 (ICCAES 2021) (オンライン)

開催年月日： 2021年12月

Roles of non-canonical DNA structures in cancer cells on mechanism of dimensional response genome

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

International Conference on Chemical and Environmental Sciences 2021 (ICCAES 2021) (オンライン)

開催年月日： 2021年12月

Regulation transcription by DNA structures responsive chemical stimulus in cells

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, N. Sugimoto

Pacifichem2021 (オンライン)

開催年月日： 2021年12月

Structure-based derivatization of berberine to improve the potency for targeting RNA structures

S. Satpathi, T. Endoh, Y. Chen, S. Matsumoto, T. Ohyama, P. Podbevšek, J. Plavec, K. Onizuka, F. Nagatsugi, N. Sugimoto

第21回東北大学多元物質科学研究所研究発表会 (東北大学片平さくらホール＆ Zoomミーティング) 東北大学多元物質科学研究所研究発表会実行委員会

開催年月日： 2021年12月

Chemical modulation of DNA replication by topology- dependent ligand binding on guanine quadruplexes

S. Takahashi, A. Kotar, H. Tateishi-Karimata, S. Bhowmik, Zi-Fu Wang, Ta-Chau Chang, S. Sato, S. Takenaka, J. Plavec, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

Triplex-forming peptide nucleic acid inhibits maturation of endogenous miRNA

T. Endoh, N. Brodyagin, D. Hnedzko, E. Rozners, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

G-quadruplex formation in cancer cells with different expression level of ion channels

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

Structure-based derivatization of berberine to improve its RNA binding affinity

S. Satpathi, T. Endoh, Y. Chen, S. Matsumoto, T. Ohyama, P. Podbevšek, J. Plavec, K. Onizuka, F. Nagatsugi, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

Changes in the atomic-level behavior of G-quadruplex under high pressure conditions

T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, S. Takahashi, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

Application of nearest-neighbor model to the stability prediction of i-motif DNAs

P. Chilka, S. Takahashi, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

Hydration parameters in nearest-neighbor model enables stability prediction for compositionally biased DNA duplexes in molecular crowding conditions

S. Ghosh, S. Takahashi, N. Sugimoto

第48回国際核酸化学シンポジウム (オンライン) 日本核酸化学会

開催年月日： 2021年11月

高圧力を用いたRNAグアニン四重らせん構造の水和特性の解析

高橋俊太郎,松本咲,杉本直己

第62回高圧討論会 (オンライン) 日本高圧力学会

開催年月日： 2021年10月

非天然塩基含有PNAによる三重らせん構造を介したmiRNAの成熟阻害

遠藤玉樹, N. Brodyagin, D. Hnedzko, E. Rozners, 杉本直己,

第15回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2021年9月

トポロジー依存的なリガンド結合でグアニン四重鎖のDNA複製を制御する

高橋俊太郎, 建石寿枝, 佐藤しのぶ, 竹中繁織, J. Plavec, 杉本直己,

第15回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2021年9月

神経変性疾患に係るリピートRNAとペプチドの相互作用解析

建石寿枝, 大山達也, 田中成典, 杉本直己,

第15回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン) 日本化学会

開催年月日： 2021年9月

Mg²⁺イオンによるグアニン四重鎖DNAの構造ダイナミクス制御

髙橋俊太郎,杉本直己

第70回高分子討論会 (（オンライン開催）) 2021年9月高分子学会

開催年月日： 2021年9月

細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築（4）

杉本直己

分子夾雑の生命科学　第5回領域会議 (（オンライン開催）)

開催年月日： 2021年4月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (72): Prediction of RNA/DNA hybrid stability under a physiological condition and verification of advantage in CRISPR-Cas9

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Tatsuya Ohyama, Marko Trajkovski, Maria Toplishek, Janez Plavec, Naoki Sugimoto

日本化学会第101春季年会 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (65): ベルベリンによるRNAバルジ構造の認識および安定化の微視的解析

遠藤玉樹, SATPATHI Sagar, 大山達也, PODBEVŠEK Peter, PLAVEC Janez, 杉本直己

日本化学会第101春季年会 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (66): 非天然DNAの複製反応に及ぼす分子クラウディングの影響

高橋俊太郎, Herdwijn Piet, 杉本直己

日本化学会第101春季年会日本化学会

開催年月日： 2021年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (67)ːDNA四重らせん構造と転写変異に及ぼすがんの悪性進行に伴う細胞内環境変化の影響

建石寿枝, 川内敬子, 大山達也, 杉本直己

日本化学会第101春季年会 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (68): 老化における細胞内環境変化によるCpGアイランドのグアニン四重らせん構造のトポロジー制御

松本咲, 大山達也, 杉本直己

日本化学会第101春季年会 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

ワトソン・クリックの核酸化学 (69):神経変性疾患に関連するRNA 四重鎖とジペプチドリピートの分子シミュレーションによる相互作用の解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己

日本化学会第101春季年会日本化学会

開催年月日： 2021年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (70) : Prediction of DNA duplex stability having biased base composition under molecular crowding conditions

Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

日本化学会第101春季年会 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

Nucleic Acid Chemistry beyond Watson-Crick Double Helix (71): I-motif stability prediction under molecular crowding conditions

Pallavi Chilka, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

日本化学会第101春季年会　 (（オンライン開催）) 日本化学会

開催年月日： 2021年3月

cMyc遺伝子のグアニン四重らせんに対する圧力効果とその生物学的意義

高橋俊太郎, 杉本直己

第61回高圧討論会 (（オンライン開催）)

開催年月日： 2020年12月

局所的な細胞内環境における核酸構造の安定性を探る

高橋俊太郎 , Ghosh Saptarshi, 杉本直己,

第69回高分子討論会 (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

Empirical rule of i-motif stability regulated by different molecular crowding conditions

PALLAVI Chilka, 高橋俊太郎,杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

神経変性疾患に関わるリピートRNAによる相分離機構の解析

建石寿枝, Ye Teng,大山達也,田中成典,杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

バルジを含むRNA二重鎖と天然アルカロイドとの相互作用解析

遠藤玉樹,SATPATHI Saga, PODBEVŠEK Peter, PLAVEC Janez, 杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

異なるGカルテット数とループ長を有するRNAグアニン四重らせんの安定性への分子クラウディングの効果

松本咲,建石寿枝,高橋俊太郎,大山達也,杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

Stability prediction of DNA duplexes available under diverse molecular crowding conditions

GHOSH Saptarshi, 高橋俊太郎, 大山達也, 遠藤玉樹, 建石寿枝, 杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

Development of the prediction method for stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition

建石寿枝,大山達也, GHOSH Saptarshi,遠藤玉樹,高橋俊太郎,杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

フラボノイドによるi-motif DNAの配列選択的な構造変化

高橋俊太郎, BHOWMIK Sudipta, 杉本直己,

第14回バイオ関連化学シンポジウム (オンライン開催)

開催年月日： 2020年9月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(57): Parameters for prediction of DNA duplex stabilities under the crowding conditions

S. Ghosh , S.Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, N.Sugimoto,

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

短鎖G4 RNAとRGGペプチドの相互作用による液-液相分離現象

小畠一起, 杉本渉, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔,

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

DNA四重らせん構造に対するリガンドスクリーニングにおけるカチオンの効果

橋本佳樹, 高宮渚, 杉本直己, 明石知子, 三好大輔

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

DNA二重鎖の熱力学的安定性に対するシトシンのメチル化と分子夾雑環境の共同効果

鶴田充生, 杉谷優衣, 杉本直己, 三好大輔,

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Chemistry of non-double helix nucleic acids in molecular crowding

N. Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(64): Effects of malignant alteration in cancer cells on the DNA structures and transcript mutations

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, T. Ohyama, N.Sugimoto,

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学(63):分子シュミレーションによるGGGGCCリピートのRNA四重鎖とジペプチドリピートの集積メカニズムの解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(62): Transformation of selective i-motif DNAs induced by flavonoid

S.Takahashi, BHOWMIK, Sudipta, N.Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(61): Effect of Neighboring Base Pairs of Cytosine Bulge on Berberine Induced RNA Stabilization

SATPATHE,Sagar, T. Endoh, N.Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(60): Interaction analyses between natural alkaloids and RNAs with different structure motifs

T. Endoh, SATPATHI, Sagar, N.Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(59): Prediction method for the stability of RNA/DNA hybrid duplex under a physiological condition

BANERJEE, Dipanwita, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, TRAJKOVSKI, Marko, TOPLISHEK, Maria, S.Takahashi, T. Endoh, PLAVEC, Janez, N.Sugimoto,

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(58): The effect of molecular crowding on the stability of RNA G-quadruplexes with various number of quartets and loops

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, S.Takahashi, N.Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 (東京理科大学・野田キャンパス)

開催年月日： 2020年3月

Imaging of molecular crowding in cells by using DNA sensor based on guanine-quadruplex

S.Takahashi, J.Yamamoto, A.Kitamura, M. Kinjo, K. Numata, N.Sugimoto

ERATO　International Symposium: Chemistry and Plant Biology (東京大学・武田ホール)

開催年月日： 2020年3月

分子夾雑環境に応答したDNAの構造変化が遺伝子発現機構に及ぼす影響を定量的に解析する

建石寿枝, 杉本直己,

新学術領域「分子夾雑の生命化学」第２回関西地区シンポジウム, 第１回 CIBIC ワークショップ (京都大学桂キャンパス)

開催年月日： 2019年12月

Light-up型蛍光小分子に結合する核酸配列の最適化技術の確立と応用

遠藤玉樹, 村瀬裕貴, 鬼塚和光, 永次史, 杉本直己

第19回東北大学多元物質科学研究所研究発表会 (東北大学片平さくらホール（仙台市）)

開催年月日： 2019年12月

Sequence Optimization to Conditionally Regulate Functional RNAs for Biotechnological Applications

T. Endoh, N. Sugimoto

13th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2019) (Konan University (Port Island Campus), Kobe, Japan)

開催年月日： 2019年12月

Liquid - Liquid Phase Separation Induced by RNA G-Quadruplexes and Cationic Peptides

Kazuki Kohata, Wataru Sugimoto, Keiko Kawauchi, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi,

13th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2019) (甲南大学,兵庫,)

開催年月日： 2019年12月

Adventure on the World of Noncanonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

The Department seminar of Padova University (Padova University, Italy)

開催年月日： 2019年11月

Adventure on the World of Noncanonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

The Department seminar of Sogang University (Sogang University)

開催年月日： 2019年11月

Adventure on the World of Noncanonical Nucleic Acids

The Symposium on Nucleic Acid Chemistry (Nucleic Acid Chemistry, Pohang University of Science and Technology (POSTECH))

開催年月日： 2019年11月

Adventure on the World of Noncanonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

The Department seminar of Sungkyunkwan University School of Medicine (Sungkyunkwan University School of Medicine)

開催年月日： 2019年11月

Adventure on the World of Noncanonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

The Department seminar of Konkuk University (Konkuk University)

開催年月日： 2019年11月

Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Kateishi-Karimata, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Analysis of the behavior of crowding molecules and their effects on DNAs at atomic level

T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Phase separation of RNA G-quadruplexes induced bycationic peptides

K. Kohata, W. Sugimoto, K. Kawauchi, N. Sugimoto, and D. Miyoshi

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Development of new prediction parameters for RNA/DNA hybrid duplex stability under a physiological

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, T. Endoh, S. Takahashi, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Screening of transcriptomic RNAs that interact with thioflavin T derivative

T. Endoh, M. Kuwahara, Y. Kataoka, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Effect of RNA topology on phase separation of peptides and proteins in neurodegenerative diseases

H. Tateishi-Karimata, Y. Teng, T. Ohyama, S. Tanaka, E. Chatani, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Topology-based DNA quadruplex sensors for characterization of intracellular crowding environments

S. Takahashi, J. Yamamoto, A. Kitamura, M. Kinjo, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム (宮地楽器ホール（小金井市）)

開催年月日： 2019年10月

Development of new prediction parameters for RNA/DNA hybrid duplex stability under a physiological buffer condition

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, T. Endoh, S. Takahashi, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム

開催年月日： 2019年10月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry (3)

N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids "ANNA2019",

開催年月日： 2019年10月

Adventures of Nucleic Acids in the Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The seminar at Faculty of Chemistry and Chemical Biology at TU Dortmund University (Dortmund University,)

開催年月日： 2019年10月

Effects of malignant alteration in cancer cells on the DNA G-quadruplex formation and transcript mutations

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, and N. Sugimoto

International Conference on Genomes and AI: From Packing to Regulation (National University of Singapore)

開催年月日： 2019年10月

Adventures of Nucleic Acids in the Molecular Crowding World

N. Sugimoto

Solvation Science Meets High Pressure Bioscience RESOLV – 10th IMBP – DFG FOR 1979 (Dortmund U tower)

開催年月日： 2019年9月 - 2019年10月

Adventures of Nucleic Acids in the Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The conference"Chemistry meets Biomedicine" (Skoltech, Russia) Skoltech

開催年月日： 2019年9月

Adventures of Nucleic Acids in the Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The Seminar of Department of Chemistry (M. V. Lomonosov Moscow State University, Russia) M. V. Lomonosov Moscow State University

開催年月日： 2019年9月

RNA-capturing microsphere particles (R-CAMPs) for optimization of functional RNAs

T. Endoh, N. Sugimoto

10th RSC-CSJ Joint Symposium– Chemistry for Complex Biological Systems– (Tohoku University)

開催年月日： 2019年9月

Role for G-quadruplexes of Nucleic Acids During Tumor Progression

H. Tateishi-Karimata and N. Sugimoto

10th RSC-CSJ Joint Symposium (Tohoku University)

開催年月日： 2019年9月

Adventures of Guanine-quadruplex in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

7th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids (Chinese Academy of Sciences)

開催年月日： 2019年9月

生理活性分子に結合する天然RNAの網羅的スクリーニング

遠藤玉樹、杉本直己

第13回バイオ関連化学シンポジウム (東北大学青葉山東キャンパス)

開催年月日： 2019年9月

Nucleic Acids Chemistry under the Molecular Crowding World

N. Sugimoto

第29回バイオ・高分子シンポジウム (東京工業大学大岡山キャンパス)

開催年月日： 2019年7月

To B or Not to B : The Watson-Crick world is not enough

N. Sugimoto

The Commemorative International Symposium of Nucleic Acid Chemistry (CISNAC2019) (Konan University, Japan) Japan Society of Nucleic Acids Chemistry (JSNAC)

開催年月日： 2019年7月

Conformational dynamics of RNA G-quadruplex affects protein expression in Escherichia coli

T. Endoh, N. Sugimoto,

The Commemorative International Symposium of Nucleic Acid Chemistry (CISNAC2019) ( Konan University)

開催年月日： 2019年7月

Adventure of Nucleic Acids in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The Seminar of Chemistry Department (Binghamton University, New York Sate University, USA)

開催年月日： 2019年6月

The Watson-Crick World Is Not Enough

N. Sugimoto

Gordon Research Conference(Nucleosides, Nucleotides and Oligonucleotides) (Salve Regina University)

開催年月日： 2019年6月

DNA四重らせん構造はがんの悪性化を制御しているのか

建石寿枝, 杉本直己

第22回生命化学研究会

開催年月日： 2019年6月

細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築

杉本直己

分子夾雑の生命科学　第3回領域会議 (アゴーラ福岡山の上ホテル＆スパ)

開催年月日： 2019年5月

Functions of Non-canonical Nucleic Acids (2)

N. Sugimoto

International Workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA) 2019” (Nankai University, Tianjing, China) Nankai University

開催年月日： 2019年4月

Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The seminar of College of Chemistry (Peking University)

開催年月日： 2019年4月

Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The seminar of School of Pharmaceutical Sciences (Peking University)

開催年月日： 2019年4月

神経変性疾患に関与するRNA/ペプチドによるPhase separationの機構解

建石寿枝, Ye Teng, 大山達也, 田中成典, 杉本直己

第2回LLPS(液液相分離)研究会 (産業技術総合研究所・臨海センター別館)

開催年月日： 2019年4月

神経変性疾患に関与するRNA/ペプチドによるPhase separationの機構解析

建石寿枝, Ye Teng, 大山達也, 田中成典, 杉本直己

第2回LLPS(液液相分離)研究会

開催年月日： 2019年4月

Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The Department Seminar of City University of Hong Kong (City University of Hong Kong) City University of Hong Kong

開催年月日： 2019年3月

RNAs in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The Seminar of Hong Kong RNA Club (Hong Kong RNA Club) Hong Kong RNA Club

開催年月日： 2019年3月

Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World

N. Sugimoto

The Department Seminar of Sun Yat-sen University (Sun Yat-sen University) Sun Yat-sen University

開催年月日： 2019年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (49): Validation of the nearest-neighbor model for self-complementary DNA duplex under molecular crowding

S. Ghosh, S.Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

Elucidation for mechanism of diseases caused by non-canonical structures of DNA and regulation for DNA function

H. Tateishi-Karimata

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(50):Phase separation of RNA/peptides in neurodegenerative diseases is promoted by chemical environment changes in cell

H. Tateishi-Karimata, Y. TENG, T.Ohyama, and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学(56): DNAの構造安定性に及ぼすメチル化と分子クラウディングの複合効果

杉谷優衣, 造住有輝, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (51): DNAとクラウディング分子の相互作用の分子動力学計算と電子状態計算による定量的解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学(岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (55): DNA四重らせん選択的リガンドのワンポットスクリーニング

長野香穂, 衣笠紫野, 萩原伸也, 佐藤綾人, 川内　敬子, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (55): DNA四重らせん選択的リガンドのワンポットスクリーニング

長野香穂, 衣笠紫野, 萩原伸也, 佐藤綾人, 川内　敬子, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (54):グアニン四重らせんおよびi-モチーフ選択的リガンドの開発

今川佳樹, 小畠一起, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (53): RNAグアニン四重らせん構造とカチオン性ペプチドによる特異的相分離現象

小畠一起, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

ucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (52) : Optimization of RNA conformational switch using RNA-capturing microsphere particle (R-CAMP)

T. Endoh and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学(岡本キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2019年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (48) :Imaging of crowding in cells by using guanine-quadruplex DNA

S.Takahashi, J. Yamamoto, A. Kitamura, M. Kinjo, and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） (甲南大学（岡本キャンパス）)

開催年月日： 2019年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (52) : Optimization of RNA conformational switch using RNA-capturing microsphere particle (R-CAMP)

杉本　直己

日本化学会第99回春季年会（2019）

開催年月日： 2019年3月

Functions of Nucleic Acids under Molecular Crowding Conditions

N. Sugimoto

The Lecture of Institute of Biophysics Czech Academy of Sciences (Institute of Biophysics Czech Academy of Sciences) Institute of Biophysics Czech Academy of Sciences

開催年月日： 2019年3月

Molecular Crowding Regulates RNA Phase Separations in Repeat Expansion Disorders

Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto

Gordon Research Conference(RNA Nanotechnology) (Four Points Sheraton / Holiday Inn Express, Ventura, CA, US)

開催年月日： 2019年1月

Molecular Crowding Effect on Functions of Nucleic Acids:

N. Sugimoto

The Department seminar (Sungkyunkwan University School of Medicine, Suwon, S.Korea)

開催年月日： 2018年12月

Molecular Crowding Effect on Functions of Nucleic Acids:

N. Sugimoto

The Department seminar (Seoul National University, Seoul, S. Korea)

開催年月日： 2018年12月

Molecular Crowding Effect on Functions of Nucleic Acids:

N. Sugimoto

The Department seminar (Korea Institute of Science and Technology (KIST) , Seoul, S. Korea)

開催年月日： 2018年12月

THE WORLD OF NON-CANONICAL NUCLEIC ACIDS

N. Sugimoto

The 9th Asian Biological Inorganic Chemistry “AsBIC9” (Stephen Riady Centre, National University of Singapore)

開催年月日： 2018年12月

Functions of Nucleic Acids with Non-canonical Structures:To B or not to B

N. Sugimoto

KONAN RESEARCH SUMMIT (FIBER, Konan University) FIBER, Konan University

開催年月日： 2018年12月

Roles of Noncanonical Nucleic Acids on Gene Expressions

N. Sugimoto

The 2nd International Symposium on “Functional Nucleic Acids: From Laboratory to Targeted Molecular Therapy" (Murdoch University, Australia)

開催年月日： 2018年11月

Optimization of junction sequence between two aptamers for constructing signaling aptamer by using RNA library on microsphere

T. Endoh, N. Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム (京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Effects of molecular crowding on nearest-neighbor rules for Watson-Crick self-complementary DNA duplexes

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, S. Hazra and N, Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム (京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Transformation of selective i-motif DNAs into hairpin-like structures induced by a flavonoid compound

S. Takahashi, S. Bhowmik, S. Ghosh, N. Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム ( 京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Structural Perspectives of the DNA binding properties of Ruthenium Polypyridyl Complexes

K. McQuaid, J. Hall, H. Abell1, S. Takahashi, N. Sugimoto, D. Allan, D. Cardin, J. Brazier, and C. Cardin

第45回国際核酸化学シンポジウム (京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Effect of G-quadruplex stability and structure in the template DNA on transcript mutations in normal and cancer cells

H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム (京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Phase separation of repeated RNA with amyloid-like protein in neurodegenerative diseases is promoted by RNA G-quadruplexes

Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム ( 京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Investigation for effects of polyethylene glycols on DNA structure and stability using molecular dynamics simulations

T. Ohyama, H.Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム (京都大学（吉田キャンパス）) 日本核酸化学会

開催年月日： 2018年11月

Optimization of junction sequence between two aptamers for constructing signaling aptamer by using RNA library on microspheres

T.Endoh, N.Sugimoto

第45回国際核酸化学シンポジウム

開催年月日： 2018年11月

Effect of noncanonical DNA structures on transcription

N. Sugimoto

The Third A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub (Lotte City Hotel, S.Korea)

開催年月日： 2018年10月 - 2018年11月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry (2)

N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids "ANNA2018"

開催年月日： 2018年10月

Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding

N. Sugimoto

The seminar of the department f Pharmacy University of Naples "Federico II" (University of Naples "Federico II")

開催年月日： 2018年10月

Analysis of structural dynamics of RNA aptamer using high pressure

S. Takahashi, T. Endoh, A. B. Rode, N. Sugimoto

The 10th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2018) (Plaza Verde, Japan)

開催年月日： 2018年9月

Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding and high pressure

N. Sugimoto

The 10th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2018) (Plaza Verde, Japan)

開催年月日： 2018年9月

リガンド複合型核酸マテリアルによる塩基損傷を受けたグアニン四重鎖の機能回復

高橋俊太郎, Kim Byeang Hyean, Stetsenko Dmitry, Plavec Janez,杉本直己

第67回高分子討論会 (北海道大学（札幌キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

グアニン四重鎖リガンドのトポロジー依存的結合様式によるDNA複製反応の制御

高橋俊太郎, Bhowmik Sudipta, Chang Ta-Cha, 佐藤しのぶ, 竹中繁織, 杉本直己

第12回バイオ関連化学シンポジウム (大阪大学（吹田キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

ポリエチレングリコールにより誘起される分子クラウディング環境がDNA四重鎖の構造安定性に与える影響の分子シミュレーション解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己

第12回バイオ関連化学シンポジウム (大阪大学（吹田キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

植物由来の天然代謝産物と核酸構造との相互作用解析

遠藤玉樹, 杉本直己

第12回バイオ関連化学シンポジウム (大阪大学（吹田キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

カリウムチャネルはがん遺伝子の転写活性をDNA四重鎖の形成によって制御しているのか？

建石寿枝, 川内敬子, 大山達也, 杉本直己

第12回バイオ関連化学シンポジウム (大阪大学（吹田キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

Gelation of RNA repeats in ALS/FTD is promoted in crowding conditions

Teng Ye, 建石寿枝, 杉本直己

第12回バイオ関連化学シンポジウム (大阪大学（吹田キャンパス）)

開催年月日： 2018年9月

Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding:To B or not to B

N. Sugimoto

XXIII International Roundtable of Nucleosides,Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2018) (University of California, San Diego, U.S.A) IS3NA（International Society for Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids）

開催年月日： 2018年8月

Nucleic Acids World under Molecular Crowding

N. Sugimoto

The 5th Asian Chemical Biology Conference (ACBC-5) ( Embassador International Hotel, Xi'an, China)

開催年月日： 2018年8月

Stability and Function of Noncanonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

The seminar of Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine (Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Russia)

開催年月日： 2018年7月

がん細胞の悪性化に及ぼすDNA四重鎖構造の解離と転写変異の影響

建石　寿枝, 川内　敬子, 杉本　直己

日本核酸医薬学会第4回年会 (九州大学医学部)

開催年月日： 2018年7月

核酸物理化学と核酸医薬の設計指針

杉本　直己

日本核酸医薬学会第4回年会 (九州大学医学部)

開催年月日： 2018年7月

分子クラウディング環境下におけるFMNリボスイッチ由来のアプタマードメインの分子挙動

遠藤玉樹, RODE Anbadas, 杉本直己

第20回日本RNA学会年会 (ホテルフクラシア大阪ベイ)

開催年月日： 2018年7月

RNA clones on microspheres for aptamer selection

T. Endoh, N. Sugimoto

FIBER International Summit for Nucleic Acids 2018 (FISNA 2018) (Konan University)

開催年月日： 2018年7月

Improved Efficiency of mRNA Sensing System by a Hydrated Ionic Liquid

Hisae Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

Gordon Research Conference(Bioanalytical Sensors) (Salve Regina University)

開催年月日： 2018年6月

Nucleic Acids Chemistry Beyond the Watson-Crick Double Helix:“To B or not to B”

N. Sugimoto

The Department seminar (Sungkyunkwan University school of medicine, South Korea) Sungkyunkwan University school of medicine

開催年月日： 2018年6月

Nucleic Acids Chemistry Beyond the Watson-Crick Double Helix:“To B or not to B”

N. Sugimoto

The Departmental seminar of College of Pharmacy (College of Pharmacy and Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Ewha Womans University, South Korea) College of Pharmacy and Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Ewha Womans University

開催年月日： 2018年6月

細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築

杉本直己

分子夾雑の生命化学　第二回領域会議

開催年月日： 2018年5月

The world of non-canonical nucleic acids: To B or not to B

N. Sugimoto

The seminer of “The role of non-canonical structure of nucleic acids” (南京農業大学) 南京農業大学

開催年月日： 2018年5月

Functions of Non-canonical Nucleic Acid

N. Sugimoto

International workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA) 2018”

開催年月日： 2018年4月

Functions of Non-canonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

International workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA) 2018” (Nankai University, China)

開催年月日： 2018年4月

Topological impact of non-canonical DNA structures on the replication

S. Takahashi, N. Sugimoto

Gordon Research Conference, DNA Damage, Mutation and Cancer ( Ventura Beach Marriot, CA, USA)

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (46): Thioflavin Tを用いたDNA I-motifの配列特異的検出

小畠一起, 赤山詩織, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (47): RNA四重らせん構造リガンドを用いた分子標的型光線力学療法の構築

高木一樹, 安井貴俊, 伊藤功彦, 杉本渉, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (45): ZnAPCによるグアニン四重らせん構造の選択的蛍光検出

今川佳樹, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (42): Quantitative analysis for effects of molecular network by crowding agents on the G-quadruplex stability

T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 ( 日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (41): Construction of RNA display from DNAs immobilized on microsphere and its application for aptamer optimization

T. Endoh, T. Ohyama, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (40): Crowding regulates the riboswitch aptamer-ligand recognition mechanism in bacterial pathogenesis mimic condition

A.B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (39) : Control of replication of G-quadruplex containing oxidative lesion

S. Takahashi, P. Podbevsek, J. Plavec, B. H. Kim, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (38): Effects of malignant alteration in cancer cells on the G-quadruplex formation and transcript mutations

H. Tateishi-Karimata, K. Kawaguchi, T, Ohyama, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (37): The formation of RNA foci in repeat expansion disorders is promoted in molecular crowding conditions

Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (43): G-quadruplex構造を安定化させる<i>N</i>-メチル化クロリン類の合成

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 民秋均

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (44): DNAの構造安定性に及ぼすヒストン模倣高分子と分子クラウディング環境の複合効果

造住有輝, 宮田貴史, 嶋田直彦, 杉本直己, 丸山厚, 三好大輔

日本化学会第98回春季年会 ( 日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (43): G-quadruplex構造を安定化させるN-メチル化クロリン類の合成

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 民秋均

日本化学会第98回春季年会 (日本大学理工学部(船橋キャンパス))

開催年月日： 2018年3月

Synthetic chlorophyll-a derivatives stabilize DNA quadruplex structures

Y. Nagano, T. Endoh, S. Ogasawara, N. Sugimoto, and H. Tamiaki

62nd Annual Meeting Biophysical Society (BPS18) (Moscone Center, San Francisco, USA)

開催年月日： 2018年2月

Chlorophyll-a derivatives bearing carboxy groups stabilize DNA G-quadruplex structures

Y. Nagano, T. Endoh, S. Ogasawara, N. Sugimoto, and H. Tamiaki

The 2nd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017) (Kihada Hall, Kyoto University, Japan)

開催年月日： 2017年12月

Effect of chemical environment change by malignant alteration in cancer cells on transcript productions from G-rich template DNAs

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, T. Ohyama, and N. Sugimoto

The 2nd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017) (Kihada Hall, Kyoto University, Japan)

開催年月日： 2017年12月

Non-canonical DNA structures control DNA replication by topology-dependent manner

S. Takahashi, J. A. Brazier, and N. Sugimoto

The 2nd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017) (Kihada Hall, Kyoto University, Japan)

開催年月日： 2017年12月

Understanding of intracellular multimolecular crowding from interaction between RNA and small molecule

T. Endoh. A. B. Rode, and N. Sugimoto

The 2nd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017 (Kihada Hall, Kyoto University, Japan)

開催年月日： 2017年12月

Molecular Crowding Effect on Nucleic Acids Chemistry:“To B or not to B”

Naoki Sugimoto

First International Symposium on Chemistry for Multimolecular Crowding Biosystems　(CMCB 2017) (神戸ポートピアホテル)

開催年月日： 2017年12月

mRNA構造のダイナミクスを考慮した疾患関連遺伝子の発現制御技術の構築

遠藤玉樹, 杉本直己

2017年度生命科学系学会合同年次大会 (神戸ポートアイランド（神戸国際会議場、神戸ポートピアホテル、神戸国際展示場、神戸商工会議所）)

開催年月日： 2017年12月

共溶質存在下におけるDNA水和水の熱力学的性質の解析

中野美紀, 建石寿枝，田中成典、Tama Florence,宮下治、杉本直己

第31回分子シミュレーション討論会 (金沢商工会議所)

開催年月日： 2017年11月 - 2017年12月

水和イオン液体中で機能するDNAセンサー

建石寿枝, 杉本直己

第8回イオン液体討論会 (東京農工大学　小金井キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

Effect of noncanonical DNA structures on DNA polymerase

Naoki Sugimoto

The Second A3 Roundtable Meeting on Asia Chemical Probe Research Hub (JINXI HOTEL, Hangzhou, China)

開催年月日： 2017年11月

Topological effect of non-canonical DNA structures on DNA replication

S.Takahashi, J.A.Brazier, N.Sugimoto

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

“Evaluation of interactions between DNA G-quadrplex and small biomolecules selected by high-throuput screenin

K.Tanabe, D.Miyoshi, N.Sugimoto, S.Nakano

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

A fluorescence based screening system for ligands targeting non-canonical DNA structures

J.Jana, T.Endoh, Y.Kataoka, S.Sato, S.Takenaka, M.Kuwahara, N.Sugimoto

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

Does molecular crowding regulate C9orf72-related ALS/FTD diseases by RNA foci formation?

Y.Teng, H.Tateishi-Karimata, N.Sugimoto

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

Relationship between malignant alteration in cancer cells and the transcript mutations byG-quadruplex formations in the template DNA

H.Tateishi-Karimata, K.Kawauchi, T.Ohyama, N.Sugimoto

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

The stabilization mechanism of cyclic naphthalene diimide binding with various topology of G-quadruplexe

T.Ohyama, H.Tateishi-Karimata, S.Takahashi, S.Sato, S.Tanaka, S.Takenaka, N.Sugimoto

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

Regulation of DNA structure and stability by combined effects of histone-mimicking polymers and osmolytes

Y.Zouzumi, N.Yamaguchi, N.Shimada, N.Sugimoto, A.Maruyama, D.Miyoshi

第44回国際核酸化学シンポジウム (東京理科大学　葛飾キャンパス)

開催年月日： 2017年11月

核酸化学における”To B or not to B"

杉本　直己

平成29年度生命融合科学教育学部シンポジウム“ライフサイエンスを開拓先導する分子科学”, 富山大学大学院生命融合科学教育部

開催年月日： 2017年11月

核酸化学における“To B or not to B”

杉本　直己

平成29年度富山大学生命融合科学教育学部シンポジウム“ライフサイエンスを開拓先導する分子科学”

開催年月日： 2017年11月

核酸化学における”To B or not to B"

杉本　直己

第15回公開セミナー(Chemical Biology) (群馬大学大学院理工学府) 群馬大学大学院理工学府

開催年月日： 2017年11月

ミン - グアニン四重鎖 DNA からなる DNAzyme の反応解析における高圧力の活用

高橋俊太郎, 杉本直己

第58回高圧討論会, (名古屋大学)

開催年月日： 2017年11月

“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry

N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2017 “ ANNA2017”,

開催年月日： 2017年10月

Transcriptional regulation by DNA structural changes responsive chemical environments in cells during tumor progression

H. Tateishi-Kartimata, N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2017 “ ANNA2017”

開催年月日： 2017年10月

Non-canonical DNA and RNA in Gene Expressions

N. Sugimoto

Mini-Symposium on Nucleic Acid Chemistry (Pohang University of Science and Technology, S.Korea) Pohang University of Science and Technology

開催年月日： 2017年10月

Function of Non-canonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

2017 SKKU International Symposium on Molecular Medicine Current Progress in Nucleic Acid Research and Application (Sungkyunkwan University school of medicine, S.Korea) Sungkyunkwan University school of medicine

開催年月日： 2017年10月

Dynamic Aptamers as New Pharmaceutical Targets

A. B. Rode, T. Endoh, and N. Sugimoto

APTAMERS 2017 (Palais de la Bourse, Bordeaux, France)

開催年月日： 2017年9月

塩基損傷を受けたグアニン四重鎖DNAの検出と構造制御を誘導するリガンド複合型核酸マテリアルの創製

高橋俊太郎, Kim Byeang Hyean, 杉本直己

第66回高分子討論会

開催年月日： 2017年9月

Beyond the Watson-Crick Double Helix:Make New History of Nucleic Acids (5)

N. Sugimoto

A3RONA2017 (Embassador International Hotel, Xi'an, China)

開催年月日： 2017年9月

DNA 四重鎖構造の安定化リガンドとしての修飾クロロフィル類の合成と機能評価

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 民秋均,

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

酸化損傷したグアニン四重鎖の検出と四重鎖形成制御

橋俊太郎, Kim Byeang Hyean, Podbevsek Peter, Plavec Janez, 杉本直己

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

癌関連遺伝子群の mRNA 上における転写反応と共役した二次構造と四重鎖構造の競合

遠藤玉樹, RODE Ambadas, 杉本直己

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

ヒストン模倣高分子のエピジェネティック修飾による DNA との結合親和性への影響

住有輝, 山口野乃花, 嶋田直彦, 杉本直己, 丸山厚, 三好大輔

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

ハイスループット解析による核酸と生体低分子の相互作用評価

田辺和也, 三好大輔, 杉本直己, 中野修一

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

細胞内模倣環境における核酸と蛋白質の非特異的な相互作用の評価

堀田政夫, 森本隆太, 中井大樹, 杉本直己

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

グアニン四重らせん構造選択的化合物のスクリーニングおよび機能解析

今川佳樹, 小畠一起, 寺田康介, 前田龍一, 中野修一, 杉本直己, 三好大輔

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

がん進行過程におけるノンコーディング領域のDNA四重らせん構造による写制御機構

建石寿枝、川内敬子、大山達也, 杉本直己

第11回バイオ関連化学シンポジウム (東京大学　弥生キャンパス)

開催年月日： 2017年9月

酸化損傷したグアニン四重鎖の検出と四重鎖形成制御,

高橋俊太郎, Kim Byeang Hyean, Podbevsek Peter, Plavec Janez, 杉本直己

第11回バイオ関連化学シンポジウム

開催年月日： 2017年9月

内環メチル化クロロフィル類とグアニン四重鎖構造との相互作用および安定化の検討

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 民秋均

第5回バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム (東京大学理学系研究科化学講堂)

開催年月日： 2017年9月

Molecular Crowding Effect on the Stability, Topology and Function of Nucleic Acids:To B or not to B

N. Sugimoto

The 7th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology

開催年月日： 2017年9月

Nanobioengineering of Non-canonical DNA and RNA

Naoki Sugimoto

The 6th International Conference on DNA Nanotechnology

開催年月日： 2017年8月

Non-canonical Nucleic Acids

Naoki Sugimoto

DNA assembly and nanotechnology (Nanjing University) Nanjing University

開催年月日： 2017年8月

Regulation of Gene Expressions by Non-canonical DNA and RNA

Naoki Sugimoto

First Conference on Biomotors, Virus Assembly, and Nanobiotechnology Applications (The Ohio State University Fawcett Center)

開催年月日： 2017年8月

Replication control by topologies of non-canonical DNA structures

Shuntaro Takahashi and Naoki Sugimoto

FIBER国際核酸サミット2017(FISNA 2017) (Konan University) Konan University

開催年月日： 2017年7月

The role of non-canonical DNA structures in the replication

S. Takahashi, N. Sugimoto

Gordon Research Conference Nucleosides, Nucleotides & Oligonucleotides (NNO) ( Salve Regina University, RI, USA)

開催年月日： 2017年6月

Y. Nagano, T. Endoh, S. Ogasawara, N. Sugimoto, and H. Tamiaki

Synthesis of N-methylated chlorin stabilizing DNA quadruplex

Thirteenth International Workshop on Supramolecular Nanoscience of Chemically Programmed Pigments (SNCPP17), (Epoc Ritsumei 21, Biwako-Kusatsu Campus, Ritsumeikan University, Japan)

開催年月日： 2017年6月

Non-canonical World of Nucleic Acids under Molecular Crowding

Naoki Sugimoto

XVIIth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components "SCNAC2107"

開催年月日： 2017年6月

New Targets of Pharmaceutical Drugs: Non-canonical DNA and RNA

Naoki Sugimoto

6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids "G4thering"

開催年月日： 2017年5月 - 2017年6月

Non-canonical Nucleic Acids

N. Sugimoto

International workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA)” (Nankai University) Nankai University

開催年月日： 2017年3月

tRNA enhances the oncogene expression through modulation of Hairpin-G-quadruplex conformational equilibrium in RNA

A. B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto

International workshop “Trends in Nucleic Acid (TINA)”

開催年月日： 2017年3月

転写・翻訳反応の教材模型の開発と活用

三村かおり, 藤田真梨子, 梅﨑瞭, 建石寿枝, 髙橋俊太郎, 遠藤玉樹, 藤井大雅, 杉本直己

日本化学会第97回春季年会

開催年月日： 2017年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (36): 嵩高いカチオン性物質共存下における核酸の構造安定性

森本隆太, 中井大樹, 鮎沢隼哉, 谷野裕一, 杉本直己, 中野修一

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

分子夾雑での遺伝子の機能とその制御

杉本　直己

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(28): A non-coding tRNA regulates functionaly important G-quadruplex-hairpin conformational equilibria in RNA

A. B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (29) : Analysis of structural dynamics of RNA aptamer using high pressure

S. Takahashi, T. Endoh, A.B. Rode, N. Sugimoto

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (30): Cyclic naphthalene diimideによるDNA四重鎖の安定化メカニズムの解明

大山達也, 建石寿枝, 高橋俊太郎, 佐藤しのぶ, 田中成典, 竹中繁織, 杉本直己

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (31): The C-rich sequence in non-template strand determines the structure of G-rich template strand during transcription

Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (32): Relationship of malignant alteration in cancer cells and the transcript mutations via DNA G-quadruplex formation

H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, N. Sugimoto

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (33): mRNAの形成する四重らせん構造を標的とした亜鉛フタロシアニンによる光切断

村田耕平, 杉本渉, 高木一樹, 杉本直己, 川内敬子, 三好大輔

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (34): ヒトテロメアDNAを標的としたリガンドスクリーニングシステムの構築

今川佳樹, 小畠一起, 寺田康介, 前田龍一,杉本直己, 三好大輔

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

脱ワトソン・クリックの核酸化学 (35): 細胞核内の化学模倣環境におけるDNA構造と熱安定性

造住有輝, 山口野乃花, 嶋田直彦, 杉本直己, 丸山厚

日本化学会第97回春季年会 (慶応義塾大学（日吉キャンパス）) 日本化学会

開催年月日： 2017年3月

Topology of non-canonical DNA structures: the role for replication

S. Takahashi, N. Sugimoto

Gordon Research Conference RNA Nanotechnology (Ventura Beach Marriott)

開催年月日： 2017年1月

Roles of Nucleic Acids with Non-canonical Structures

N. Sugimoto

FIBER-SLONMR シンポジウム (Slovenia NMR Center) Slovenia NMR Center

開催年月日： 2016年12月

グアニン四重鎖をターゲットとした共有結合性リガンドによるDNA複製, 転写の制御

高橋俊太郎、建石寿枝、佐藤憲大、鬼塚和光、永次史、杉本直己

第16回東北大学多元物質科学研究所　研究発表会

開催年月日： 2016年12月

Regulation of Gene expressions Using the Formation of Non-canonical Structures of DNA and RNA

Hisae Tateishi-Karimata and Naoki Sugimoto

The Fourth Asian Chemical Biology Conference (85 Sky Tower Hotel, Kaohsiung, Taiwan)

開催年月日： 2016年11月 - 2016年12月

テトラエチレングリコール修飾塩基をもつ四重鎖構造を用いた逆転写反応制御

建石寿枝、大山達也、村岡貴博、Peter Podbevsek、田中成典、金原数、Janez Plavec、杉本直己

日本核酸医薬学会　第2回年会 (東京理科大学　葛飾キャンパス図書館大ホール)

開催年月日： 2016年11月

Stability and function of nucleic acids under molecular crowding conditions

Naoki Sugimoto

BIT's 7th World Gene Convention 2016 (Sheraton Shanghai Waigaoqiao Hotel, Shanghai, China)

開催年月日： 2016年11月

Nucleic acids with non-canonical structures

Naoki Sugimoto

国際大学院設立を目指したChemical Communication Symposiumミニプレシンポジウム＆次世代メディカル・バイオ機能材料への展開を目指した生体分子素子技術の開発[B-2]ポストシンポジウム (東北大学　多元物質研究所（片平キャンパス）＆　青葉サイエンスホール（青葉山北キャンパス）)

開催年月日： 2016年10月

RNAポリメラーゼリボザイム活性のP-T依存症

高橋俊太郎、大倉裕道、杉本直己

第57回高圧討論会 (茨城県つくば市　筑波大学)

開催年月日： 2016年10月

Investigation of G-quadruplex transformation in G-rich template during transcription

Ye Teng, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Stabilization mechanizm of G-quadruplex modified with oligoethylene glycols by dispersion force

Tatsuya Ohyama, Hisae Tateishi-Karimata, Peter Podbevsek, Takahiro Muraoka, Kazushi Kinbara, Shigenori Tanaka, Janez Plavec, Naoki Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Effect of cyclic naphthalene diimide on the topology dependent replication reaction

Shuntaro Takahashi, Hiromichi Okura, Shinobu Sato, Shigeori Takenaka, Naoki Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Effect of molecular crowding on the nucleotide selectivity of RNA polymerase

Hiromichi Okura, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Stabilization of A-form nucleic acid by synthetic cationic copolymers

Yu-ki Zouzumi, Nonoka Yamaguchi, Naohiko Shimada, Shu-ichi Nakano, Naoki Sugimoto, Atsushi Maruyama, Daisuke Miyoshi

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

effects of epigenetic modifications of histone tails on transcriptional efficiency

Kohei Murata, Shu Higashida, Smritimoy Pramanik, Naoki Sugimoto, Disuke Miyoshi

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Hairpin-G-quadruplex conformational transition affects gene expression in cells

Tamaki Endoh, Naoki Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016） (熊本大学工学部百周年記念館（黒髪南地区キャンパス）)

開催年月日： 2016年9月

Novel function of tRNA: A regulator of oncogenes expression through switching hairpin-G-quadruplex equilibrium

A.B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto

第43回国際核酸化学シンポジウム（ISNAC2016）

開催年月日： 2016年9月

How does a helicase assist the replication of G-quadruplex DNA?

Hiromichi Okura, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub (Hotel LEOPALACE Hakata)

開催年月日： 2016年9月

核酸非標準構造のトポロジーを活用した酵素反応の制御

高橋俊太郎、杉本直己

第65回高分子討論会 (神奈川県横浜市　神奈川大学)

開催年月日： 2016年9月

テトラエチレングリコール修飾によるDNA四重鎖の安定化機構の解明

大山達也、建石寿枝、田中成典、村岡貴博、金原数、杉本直己

第10回分子科学討論会 (神戸ファッションマート)

開催年月日： 2016年9月

がん化による細胞内の化学環境の変化がc-Myc遺伝子上のグアニンリッチ配列の転写に及ぼす影響

建石寿枝、川内敬子、杉本直己

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

亜鉛フタロシアニンによるがん関連mRNAの光切断

村田耕平、杉本渉、高木一樹、松野仁志、杉本直己、川内敬子、三好大輔

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

核酸の非標準構造を標的とした先制核酸医工学

杉本直己

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

RNA酵素の活性を向上させる方法の開発

山下博史、小林未来、田辺和也、杉本直己、中野修一

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

PNA-RNA三重鎖の速度論的、熱力学的バラメータに対するpHの影響

遠藤玉樹、Annoni Chiara、Hnedzko Dziyama, Rozners Eriks、杉本直己

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

がん関連遺伝子のグアニン四重鎖構造に対する酸化損傷の影響

高橋俊太郎、Podbevsek Peter、藤井大雅、Plavec Janez、杉本直己

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

グラフェン酸化物-DNAバイオセンサーの検出感度に対するDNA構造の効果

造住有輝、坂下祐介、上田侑美、杉本直己、三好大輔

第10回バイオ関連化学シンポジウム (石川県金沢市　石川県立音楽堂)

開催年月日： 2016年9月

DNA非二重らせん構造を介した転写機能制御

建石寿枝

生命理工学融合セミナー2016若手から発信するナノサイエンス,

開催年月日： 2016年8月

Stability and Function of Nucleic Acids with Non-canonical Structures

Naoki Sugimoto

Waterloo Institute for Nanotechnology (WIN) Seminar (University of Waterloo, Canada)

開催年月日： 2016年7月

High pressure in RNA world: High pressure dominates the aptamer ligand binding of flavin mononucleotide riboswitch

Shuntaro Takahashi, Tamaki Endoh, Ambadas B. Rode, Naoki Sugimoto

The 9th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2016) (Leslie Dan Faculty of Pharmacy, University of Toronto, Canada)

開催年月日： 2016年7月

Does a helicase assist the replication of G-quadruplex DNA?

Hiromichi Okura, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

The 22th International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (XXII IRT) (Institut Pasteur, Paris, France)

開催年月日： 2016年7月

Regulation of reverse transcription via the stable G-quadruplex formation

Hisae Tateishi-Karimata and Naoki Sugimoto

FIBER国際核酸サミット2016 (Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER), Konan University)

開催年月日： 2016年7月

Beyond the Watson-Crick DNA World: Functionsof nucleic acids with non-canonical structures and their regulations

Naoki Sugimoto

第53回化学関連支部合同九州大会 (北九州国際会議場)

開催年月日： 2016年7月

Novel DNA sensor developed with hydrated ionic liquid of choline dihydrogen phosphate

Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

Gordon Research Conferences 2016 (Bioanalytical Sensors) (Salve Regina University, Newport, RI, USA)

開催年月日： 2016年6月 - 2016年7月

Functions of nucleic acids with non-canonical structures

N. Sugimoto

Euro Chemistry 2016 (Holiday Inn Rome Aurelia, Rome, Italy)

開催年月日： 2016年6月

mRNAが形成する四重らせん構造を狙った分子標的型光線力学療法

村田耕平、松野仁志、杉本渉、川内敬子、杉本直己、三好大輔

日本ケミカルバイオロジー学会　第11回年会 (京都テルサ　テルサホール)

開催年月日： 2016年6月

Does tRNA induce the structural transition from G-quadruplex to Hairpin in RNA?

A.B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto

Gordon Research Conference 2016 (Mutagenesis) (PGA Catalunya Business and Convention Centre, Girona, Spain)

開催年月日： 2016年6月

Co-transcriptional G-quadruplex formation affected by mutually exclusive hairpin

T. Endoh, A. Rode, S. Takahashi, Y. Kataoka, M. Kuwahara, N. Sugimoto

ANNA2016 (Advances in Noncanonical Nucleic Acids) (National Institute of Chemistry, Ljubljana, Slovenija)

開催年月日： 2016年5月

Regulation of gene expressions using the formation of non-canonical structures of nucleic acids

H. Tateishi-Karimata, C. Annoni, A.B. Rode, T. Endoh, S. Takahashi, N. Sugimoto

ANNA2016 (Advances in Noncanonical Nucleic Acids) (National Institute of Chemistry, Ljubljana, Slovenija)

開催年月日： 2016年5月

Pressure control of the formation of G-quadruplex and i-motif DNA

S. Takahashi, N. Sugimoto

ANNA2016 (Advances in Noncanonical Nucleic Acids) (National Institute of Chemistry, Ljubljana, Slovenija)

開催年月日： 2016年5月

生体分子を含んだクラウディング環境がDNAに与える安定性変化のメカニズム

中井大樹、山口大輔、杉本直己、中野修一