書籍等出版物 - 杉本 直己
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Stability Prediction of Canonical and Noncanonical Structures of Nucleic Acids.
S. Takahashi, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids.Springer 2023年
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Liquid Phase Separation and Nucleic Acids
H. Tateishi-Karimata, S. Matsumoto, N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids.Springer 2023年
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Effects of Molecular Crowding on Structures and Functions of Nucleic Acids.
T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids.Springer 2023年
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Chemistry and Biology of Non-canonical Nucleic Acids
N. Sugimoto（ 担当： 単著）
WILEY 2021年4月
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相分離生物学の全貌（現代化学増刊46）
建石寿枝, 杉本直己（ 担当： 共著 , 範囲: 第Ⅳ部 生物学的相分離の理論）
東京化学同人 2021年
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核酸科学ハンドブック
杉本 直己（ 担当： 編集）
講談社 2020年12月
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第Ⅳ部 生物学的相分離の理論
建石 寿枝, 杉本 直己（ 担当： 共著）
相分離生物学の全貌（現代化学増刊46）（東京化学同人） 2020年11月
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Quantitative Analysis of Stall of Replicating DNA Polymerase by G-Quadruplex Formation
S. Takahashi and N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Methods in Molecular Biology (Methods Mol. Biol.)Springer 2019年
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Development and Application of a Highly Efficient Protein Synthesis Technique Using Riboswitches in Microorganisms
T. Yamauchi, N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Applied RNA Bioscience (Springer) 2018年4月
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15章 新しい核酸医薬システムの構築, CSJカレントレビュー「生命機能に迫る分子化学」
建石寿枝、杉本直己（ 担当： 共著）
化学同人 2018年
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生体分子化学 基礎から応用まで
杉本直己（ 担当： 共著）
講談社 2017年1月 （ ISBN:978-4-06-156806-8 ）
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第4章 遺伝子診断の新手法, CSJカレントレビュー「医療・診断・創薬の化学」
建石寿枝, 杉本直己（ 担当： 共著）
化学同人 2017年
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Noncanonical Structures and Their Thermodynamics of DNA and RNA Under Molecular Crowing: Beyond the Watson-Crick Double Helix
N. Sugimoto（ 担当： 単著）
International Review of Cell and Molecular Biology (Elsevier), 307, 205-273 2014年
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Effect of Ionic Liquid and Liposomes on the Structure, Stability, and Function of Nucleic Acids
N. Sugimoto（ 担当： 単著）
Chemical Biology of Nucleic Acids: Fundamentals and Clinical Applications (Springer), in press 2014年
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高圧下での核酸の挙動
杉本直己, 高橋俊太郎（ 担当： 共著）
CSJカレントレビュー 極限環境の生命化学(化学同人), 17, 110-118 2014年
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Molecular Crowding and Hydration Regulating of G-Quadruplex Formation
D. Miyoshi, T. Fujimoto and N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Quadruplex Nucleic Acids (Springer) , 330, 87-110 2013年
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Chapter 5, Molecular crowding and hydration regulating of G-quadruplex formation
杉本 直己
Quadruplex Nucleic Acids (Springer) 2013年
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新しい薬学辞典
長門石曉, 杉本直己（ 担当： 共著）
A12 核酸医薬 朝倉書店、46-50 2012年8月
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Chapter 8 Nucleic Acid Aptamers as Molecular Tags for Omics Analyses Involving Sequencing
M. Kuwahara and N. Sugimoto（ 担当： 共著）
DNA SEQUENCING, METHODS AND APPLICATIONS (InTech), 157-174 2012年
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シグナル解析を目指した機能性核酸の構築
杉本直己, 三好大輔（ 担当： 共著）
細胞定量解析の最前線－ライフサーベイヤ構築に向けて－（シーエムシー出版）, 27-37 2012年
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細胞内核酸化学 ここまで進んだバイオセンシング・イメージング 1分子から細胞，脳まで
遠藤玉樹, 杉本直己（ 担当： 共著）
CSJカレントレビュー（化学同人）, 86-91 2012年
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シグナル解析を目指した機能性核酸の構築－ライフサーベイヤ構築に向けて－
杉本 直己
シーエムシー出版 2012年
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核酸化学の定量的基礎と仮説
杉本 直己（ 担当： 単著）
CSJカレントレビュー 核酸化学のニュートレンド 化学同人、6,10-17 2011年6月
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G-quartet, G-quadruplex, and G-wire Regulated by Chemical Stimuli
D. Miyoshi and N. Sugimoto（ 担当： 共著）
DNA Nanotechnology (Springer), 749, 93-104 2011年5月
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化学ツールとしての分子クラウディングの活用
中野修一,杉本直己（ 担当： 共著）
化学フロンティア22 生命現象を理解する分子ツール（化学同人） 18章 2010年10月
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DNAチップの基礎 ハイブリダイゼーション
中野修一, 杉本直己（ 担当： 共著）
バイオチップ実用化ハンドブック (エヌ・ティー・エス), 13-19 2010年3月
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生体シグナル解析用の機能性核酸センサーの定量的デザイン
中野修一, 杉本直己（ 担当： 共著）
シングルセル解析の最前線 (シーエムシー出版), 9-16 2010年3月
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機能性核酸のテーラーメード設計
杉本直己, 三好大輔（ 担当： 共著）
超分子サイエンス＆テクノロジー（エヌ・ティー・エス）, 921-929 2009年5月
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セントラルドグマに学ぶセントラルドグマの制御方法
三好大輔, 杉本直己（ 担当： 共著）
核酸医薬の最前線（シーエムシー出版）, 1-13 2009年3月
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Energy of nucleic acid self-assemblies: From sequence to function through structure bottom-up nanofabrication:supramolecules
S. Nakano, N. Sugimoto（ 担当： 単著）
Self-Assemblies, and Organized Films (American Scientific Publishers) 2009年
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核酸超分子と分子認識 「分子認識と超分子」
杉本 直己（ 担当： 単著）
（三共出版）, ８章 139-156 2007年12月
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５）天然高分子 核酸 「エネルギーデータに基づく核酸医薬の設計」
杉本直己, 甲元一也（ 担当： 共著）
絵で見てわかるナノDDS 遺伝子医学MOOK別冊（メディカルドゥ）, 63-69 2007年12月
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第Ⅲ部 新しい蛍光試薬 「Quantum Dot-量子ドット」
赤松謙祐, 鶴岡孝章, 縄舟秀美, 杉本直己（ 担当： 共著）
実験がうまくいく 蛍光・発光試薬の選び方と使い方 (羊土社), 164-170 2007年10月
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生命化学 Biochemistry
杉本 直己（ 担当： 単著）
丸善, 200頁 2007年10月
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2.7 リボザイム
杉本直己, 大道達雄（ 担当： 共著）
生物物理学ハンドブック(朝倉書店) 2007年4月
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2.7)リボザイム
杉本 直己
生物物理学ハンドブック（朝倉書店） 2007年
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Quantum Dot－量子ドット
杉本 直己
実験がうまくいく 蛍光・発光試薬の選び方と使い方（羊土社） 2007年
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核酸超分子と分子認識
杉本 直己
分子認識と超分子（三共出版） 2007年
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生命化学
杉本 直己
丸善 2007年 （ ISBN:978-4-621-07907-2 ）
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5) 天然高分子 核酸 エネルギーデータに基づく核酸医薬の設計
杉本 直己
絵で見てわかるナノDDS 遺伝子医学MOOK別冊（メディカルドゥ） 2007年
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Use of the polymorphic nature of high-order DNA structures for the design of dynamic and functional nanodevices (Recent Devel, Nucleic Acids Res)
D. Miyoshi and N. Sugimoto（ 担当： 共著）
Oxford Journal, 2, 49-70 2006年1月
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デザイナブル核酸修飾
杉本直己, 中野修一, 大道達雄（ 担当： 共著）
ウィルスを用いない遺伝子法の材料、技術、方法論の新たな展開、遺伝子医学MOOK5 (メディカルドゥ), 245-251 2006年
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シグナル解析を目指した機能性核酸の構築
杉本直己, 三好大輔（ 担当： 共著）
－細胞定量解析の最前線－ライフサーベイヤ構築に向けて－(シーエムシー出版), 23-37 2006年
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Use of the polymorphic nature of high-order DNA structures for the design of dynamic and functional nanodevices
杉本 直己
Recent Devel, Nucleic Acids Res. (Transworld Research Network) 2006年
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生命分子を用いたサブナノデバイスの創製
杉本 直己（ 担当： 単著）
未来材料（エヌ・ティー・エス） 2004年11月
未来材料（エヌ・ティー・エス） (学術雑誌, 2004）/ 4, 7, 26-33
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フォトバイオエンジニアリング
杉本直己, 村嶋貴之（ 担当： 共著）
ナノバイオエンジニアリング(化学同人) 2004年11月
ナノバイオエンジニアリング(化学同人) (学術雑誌, 2004）/9章, 95-107
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細胞ナノエンジニアリング
杉本直己（ 担当： 単著）
化学フロンティア13，ナノバイオエンジニアリング (化学同人）,16章, 95-107 2004年
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生命分子間認識を解明するには、ラショナル法でいくべきかランダム法でいくべきか？ それが問題だ
杉本直己（ 担当： 単著）
先端化学シリーズⅢ 糖鎖／バイオマテリアル／分子認識／バイオインフォマティクス（丸善）, Ⅱ章, 11, 121-129 2003年
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２５章 生命分子と表面プラズモン効果
杉本直己, 安田恭子（ 担当： 共著）
生命科学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの化学(化学同人), 256-262 2002年
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１０章 タンパク質の構造・機能化学
杉本直己, 三好大輔（ 担当： 共著）
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの（化学同人）, 104-117 2002年
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５章 機能性核酸
杉本直己, 大道達雄（ 担当： 共著）
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの（化学同人）, 54-62 2002年
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２章 核酸の相互作用
杉本直己, 中野修一（ 担当： 共著）
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの（化学同人）, 24-34 2002年
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遺伝子化学
杉本直己（ 担当： 単著）
(化学同人), 1-204 2002年
化学同人（単行本、2002）/
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ゲノム化学とSNPs解析 化学の系たす役割
杉本直己, 三好大輔, Peng Wu（ 担当： 共著）
別冊化学 ヒトゲノム最前線 21世紀は遺伝子の時代 (化学同人), 31-57 2001年11月
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ゲノム化学とSNPs解析 化学の果たす役割
杉本 直己
別冊化学, ヒトゲノム最前線21世紀は遺伝子の時代（化学同人） 2001年
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遺伝子とバイオテクノロジー
杉本直己（ 担当： 単著）
(丸善), 1-164 1998年
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バイオテクノロジー-新しいタイプの酵素RNA酵素(リボザイム).
杉本 直己（ 担当： 単著）
化学便覧 応用化学編 (丸善), 2版 9章 5-46 1994年11月
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Thermodynamics and kinetics of Base-pairing of DNA and RNA Self-assembly and Helix-coil Transition
SUGIMOTO Naoki
Nucleic Acids(Springer-Verlag) 1990年
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Improved parameters for prediction of RNA secondary structure and insights into why RNA forms double helixes
D. H. Turner, S. M. Freier, N. Sugimoto, D. R. Hickey, J. A. Jaeger, A. Sinclair, D. Alkema, T. Neilson, M. H. Caruthers and R. Kierzek（ 担当： 共著）
Structure and Dynamics of RNA (P. H. van Knippenberg and C. W. Hibers, Eds.), Plenum Press, NY, pp1-13 1986年