髙橋 俊太郎 (タカハシ シュンタロウ)
TAKAHASHI Shuntaro
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職名 |
准教授 |
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学位 |
博士（工学）(東京工業大学) |
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専門分野 |
生体化学 |
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外部リンク |
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学外略歴 【 表示 ／ 非表示 】
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東京工業大学 大学院生命理工学研究科
2012年4月 - 2012年5月
国名：日本国
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東京工業大学 大学院生命理工学研究科
2007年10月 - 2012年3月
国名：日本国
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東京工業大学
2007年4月 - 2007年9月
国名：日本国
所属学協会 【 表示 ／ 非表示 】
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高分子学会
2015年4月 - 現在
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日本高圧力学会
2012年9月 - 現在
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日本化学会生体機能関連部会
2007年4月 - 現在
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日本化学会
2003年1月 - 現在
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日本RNA学会
2008年4月 - 現在
研究経歴 【 表示 ／ 非表示 】
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高圧力下での核酸関連化学
科学研究費補助金
研究期間： 2012年6月 - 現在
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水晶発振子マイクロバランス法を用いた翻訳反応の解析
科学研究費補助金
研究期間： 2007年4月 - 現在
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Stability of non-canonical nucleic acid structure as a potential modulator of cell fate
Shuntaro Takahashi, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto
Nucleic acids research 2026年1月
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Dynamic regulation of nucleic acid replication beyond the Watson–Crick base-pairing rule
Shuntaro Takahashi, Lutan Liu, Naoki Sugimoto
Chemical communications 2026年
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Shuntaro Takahashi, Saptarshi Ghosh, Marko Trajkovski, Tatsuya Ohyama, Janez Plavec, Naoki Sugimoto
Nucleic acids research 2025年6月
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Predictability of environment-dependent formation of G-quadruplex DNAs in human mitochondria 招待あり 査読あり
Lutan Liu, Shuntaro Takahashi, Sarptarshi Ghosh, Tamaki Endoh, Naoto Yoshinaga, Keiji Numata, Naoki Sugimoto
Communications chemistry 2025年5月
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Fitness landscapes and thermodynamic approaches to development of nucleic acids enzymes: from classical methods to AI integration
Shuntaro Takahashi, Michiaki Hamada, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto
RSC chemical biology 2025年
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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Quantitative Analysis of Stall of Replicating DNA Polymerase by G-Quadruplex Formation
Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto（ 担当： 共著）
Springer 2019年8月
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生体分子化学 基礎から応用まで
杉本直己・編著（ 担当： 共編者(共編著者)）
講談社 2017年1月 （ ISBN:978-4-06-156806-8 ）
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生体分子化学 : 基礎から応用まで = biomolecular chemistry
杉本, 直己, 内藤, 昌信, 橋詰, 峰雄, 高橋, 俊太郎, 田中, 直毅, 建石, 寿枝, 遠藤, 玉樹, 津本, 浩平, 長門石, 曉, 松原, 輝彦, 上田, 実, 朝山, 章一郎, 講談社サイエンティフィク
講談社 2017年1月 （ ISBN:9784061568068 ）
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高圧下での核酸の挙動、CSJカレントレビュー17極限環境の生命化学
高橋俊太郎,杉本直己（ 担当： 共著）
化学同人 2014年11月
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バイオセンシングのための水晶発振子マイクロバランス法ー原理から応用例まで
岡畑恵雄,森俊明,古澤宏幸,高橋俊太郎（ 担当： 共編者(共編著者)）
講談社サイエンティフィク 2013年3月
総説・解説記事（Misc） 【 表示 ／ 非表示 】
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高圧力が生物関連成分に及ぼす影響-1 高圧力がDNAに及ぼす影響 非標準構造と分子クラウディングの視点
高橋俊太郎, 杉本直己, 杉本直己
化学と生物 58 ( 8 ) 2020年8月
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平成の化学キーワード 核酸の多様性を生みだすもう一つの塩基対相互作用 フーグスティーン塩基対
高橋俊太郎、杉本直己
化学 74 ( 5 ) 24 - 25 2019年5月
担当区分：筆頭著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌） 出版者・発行元：化学同人
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分子夾雑系の生命化学（２）
高橋俊太郎、杉本直己
現代化学 575 34 - 38 2019年2月
担当区分：筆頭著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌） 出版者・発行元：東京化学同人
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (20) : G-quadruplex DNA formations depending on the environments in the mitochondrial matrix
L. Liu, S. Takahashi, G. Sarptarshi, T. Endoh, N. Yoshinaga, K. Numata, N. Sugimoto
日本化学会第105回春季年会
開催年月日： 2025年3月
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New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (12) : Role of groove hydration on stability and functions of biased DNA duplexes
N. Sugimoto, S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, L. Liu
日本化学会第105回春季年会
開催年月日： 2025年3月
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New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (14), Development of methods to predict RNA secondary structures in cells
H. Tateishi-Karimata, D. Banerjee, S. Takahashi, T. Nishimura, T. Fukunaga, M. Hamada, M. Orehova, J. Plavec, N. Sugimoto
日本化学会第105回春季年会
開催年月日： 2025年3月
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New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (15): Universal prediction of DNAzyme activity using new nearest neighbor parameters and AI
S.Takahashi, T. Nishimura, S. Ghosh, H. Tateishi-Karimata, T. Fukunaga, M. Hamada, N. Sugimoto
日本化学会第105回春季年会
開催年月日： 2025年3月
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, New Data Science in Nucleic Acids Chemistry (18) : Comparison of the stability of DNA duplexes among normal and cancer cells
K. Chen, H. Tateishi-Karimata, S. Takahashi, N. Sugimoto
日本化学会第105回春季年会
開催年月日： 2025年3月
産業財産権 【 表示 ／ 非表示 】
学術関係受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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第29回山下太郎学術研究奨励賞
2018年6月 財団法人 山下太郎顕彰育英会
高橋俊太郎
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第5回バイオ関連シンポジウム講演賞
2011年9月 日本化学会生体機能関連部会
高橋俊太郎
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The 16th Annual Meeting of the RNA Society Nature Reviews Molecular Cell Biology Poster Prizes（2011）
2011年6月 The RNA Society
高橋俊太郎
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2010年度 財団法人手島工業教育資金団 手島精一記念研究賞
2011年2月 東京工業大学
高橋俊太郎,古澤宏幸,岡畑恵雄
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第89回日本化学会年会春期年会 (2009) 優秀講演賞
2009年3月 日本化学会
高橋俊太郎
科研費（文科省・学振）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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いつ、どこで、どのように、核酸の高次構造は形成し機能するのかを予測する
2022年4月 - 2027年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 基盤研究(S)
杉本 直己, 松浦 和則, 沼田 圭司, 遠藤 玉樹, 高橋 俊太郎, 建石 寿枝
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ミトコンドリア内環境に依存したDNA複製阻害の定量的解析と化学的制御
2021年4月 - 2024年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
高橋 俊太郎
本研究は、ミトコンドリア内の化学環境変化によってmtDNAの変異が生じる化学的メカニズムを定量的に解明することを目的とする。そのために、本研究ではミトコンドリア内の溶液環境を解析し、その物理化学的な物性を決定する。続いて、決定された溶液物性と同等の物性を有する擬似的なミトコンドリア環境を調整する。その中で四重鎖形成の熱力学的安定性や複製反応の動力学を解析することで、ミトコンドリア内環境での複製阻害効果を定量的に評価する。さらに、溶液の物性を変化させることで、四重鎖構造による複製阻害が生じる化学的環境を系統的に調べ、ミトコンドリア内の化学環境変化に伴うmtDNAの変異発生の関連性を明らかにする。
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細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御
2018年10月 - 2021年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
杉本 直己, TENG Ye, 建石 寿枝, 高橋 俊太郎, 遠藤 玉樹, GHOSH SAPTARSHI
本研究では、非標準核酸構造の安定性と立体構造を細胞内環境で解析し、非標準核酸構造による遺伝子発現制御機構を分子レベルで解明することを目的としている。2018年度はまず、細胞内環境で遺伝子発現制御する非標準構造のエネルギーパラメータの測定を開始した。研究分担者の建石とTengが中心となり、ヒトのDNA配列からがんや神経疾患に関連する非標準構造を対象に、化学的環境変化への応答を解析した。紫外可視吸光度測定と円二色性測定から熱力学的安定性や核酸構造を解析することで、共存溶質、pH、イオン濃度などの化学環境の変化による非標準核酸構造の安定化エネルギーの変化を定量的に得た。また、細胞内のような分子で混み合った環境を模倣すると考えられる分子結晶内での構造解析の条件検討を開始した。そのために、ヒトのがん遺伝子の一種であるVEGF遺伝子のプロモーター領域の配列が形成する非標準核酸構造の１つであるi-motifについて、結晶化の検討を研究分担者の高橋がイギリスReading大学で開始した。さらに、細胞内での非標準核酸構造を実測するための準備として、研究代表者の杉本がチェコMasaryk大学に訪問し、分担者の建石が行った細胞実験のデータを基に細胞内NMR測定の予備的検討と、今後の測定における 細かな実験条件の打ち合わせを行った。細胞・個体レベルでの非標準核酸構造の機能制御の研究にも着手し、研究分担者の遠藤が中国南京農業大学に出向いてイネの組織毎のRNAを取得し、イネの発生や分化、組織形成などの各成長段階において変動する非標準核酸構造の解析を開始した。
国際交流として、イギリス、チェコ、中国それぞれにおいて学会あるいはセミナー形式で研究発表も行い、さらなる国際共同研究の可能性を拡げることができた。 -
核酸四重鎖のトポロジーで支配される細胞内機能の解明と制御
2017年4月 - 2021年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
本研究の目的は、様々なトポロジーを有する核酸四重鎖の熱力学的安定性とDNA複製速度を多角的に定量解析する手法を開発し、核酸四重鎖のトポロジーが持つ生物学的意義を解明することである。開発した解析法を活用することで、四重鎖のトポロジーの違いをターゲットとするという新しいコンセプトに基づく薬剤分子の探索・開発を行い、細胞内機能の人為的制御を目指す。
研究費にかかる研究（調査）活動報告書 【 表示 ／ 非表示 】
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2024年度 ゲノム変異を引き起こす非ワトソン-クリック型塩基対の化学的基盤の解明
研究費の種類： 科研費
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2023年度 ミトコンドリア内環境に依存したDNA複製阻害の定量的解析と化学的制御
研究費の種類： 科研費等
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2022年度 高圧力による核酸の構造解析
研究費の種類： 科研費等
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2021年度 高圧力による核酸の構造解析
研究費の種類： 科研費等
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2020年度 高圧力による核酸の構造解析
研究費の種類： 科研費等
所属学協会等の委員歴 【 表示 ／ 非表示 】
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2025年9月 - 現在 日本高圧力学会 評議委員
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2025年 第19回バイオ関連化学シンポジウム 実行委員
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2024年 実行委員
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2019年 - 2022年 日本高圧力学会 高圧力学会誌編集委員
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2010年4月 - 2012年3月 日本化学会 生体機能関連化学部会若手の会代表幹事
社会貢献活動 【 表示 ／ 非表示 】
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ひらめき☆ときめきサイエンス 「遺伝子暗号を解く」〜光で操る 遺伝子からタンパク質ができるまで〜
2013年7月
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ひょうご神戸サイエンスクラスター研究交流会企画委員
2012年9月 - 現在
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ひらめき☆ときめきサイエンス 人工DNAによる次世代バイオセンサー –遺伝子の情報を探れ！−
2012年7月
提供可能な資源 【 表示 ／ 非表示 】
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高圧力分光装置
高圧力発生装置を紫外分光光度計や蛍光分光光度計と接続し、分光特性の圧力依存性を評価する。
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水晶発振子マイクロバランス
水晶発振子マイクロバランス法を用いた分子間相互作用観察