三好 大輔 (ミヨシ ダイスケ)
MIYOSHI Daisuke
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職名 |
教授 |
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学位 |
博士（理学）(甲南大学) |
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専門分野 |
生体分子設計化学, 生物物理学, 生物分子化学, ケミカルバイオロジー, 811核酸化学 生物有機化学, ナノバイオサイエンス |
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学内職務経歴 【 表示 ／ 非表示 】
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甲南大学 フロンティアサイエンス学部 生命化学科 教授
2015年4月 - 現在
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甲南大学 フロンティアサイエンス学部 生命化学科 准教授
2009年4月 - 2015年3月
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甲南大学 先端生命工学研究所 講師
2004年4月 - 2009年3月
所属学協会 【 表示 ／ 非表示 】
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米国化学会
2010年4月 - 現在
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生命化学研究会
2004年4月 - 現在
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生体機能化学部会
2005年4月 - 現在
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Identification of Ligand-Responsive RNA G-Quadruplexes in the 3′ UTRs of Dengue Virus Serotypes 査読あり
Mohammad Jafar Sheikhi, Ayuka Onuma, Yutaro Imachi, Akira Shiraishi, Shoko Mori, Kohtaro Sugahara, Daisuke Miyoshi, Yue Ma, Takayuki Hishiki, Kazuo Nagasawa and Masayuki Tera
Biomolecules 2026年6月
DOI： 10.3390/biom16070946
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Exclusion of RNA-binding domains from G-quadruplex condensates by G-quadruplex ligands 招待あり 査読あり 国際共著
Yoshiki Hashimoto, Ryosuke Suzuki, Mizuho Aya, Nagisa Takamiya, Mitsuki Tsuruta,Takeru Torii, Toshiyuki Goto, Keiko Kawauchi and Daisuke Miyoshi
RSC Chemical Biology 2026年6月
担当区分：最終著者, 責任著者
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Loss of p53 Provokes NF-κB-Dependent Disruption of Nucleolar Cap and Nucleoplasmic Redistribution of Fibrillarin During Nucleolar Stress
Takeru Torii, Mako Sumida, Atsushi Kobayashi, Toshiyuki Goto, Ryosuke Suzuki, Shin Kuwamoto, Wataru Nakajima, Wataru Sugimoto, Kohei Takeuchi, Yuma Tanaya, Masayuki Tera, Nobuyuki Tanaka, Hiroaki Hirata, Hisae Tateishi-Karimata, Takahito Nishikata, Miwako Kato Homma, Daisuke Miyoshi, Keiko Kawauchi
BIOMOLECULES 16 ( 2 ) 2026年2月
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Investigation of the physicochemical and functional properties of poly(2-methacryloyloxyethyl phosphorylcholine)-conjugated aptamers. 国際誌
Seojung Cho, Jumpei Morimoto, Yutaro Saito, Yukiko Nagai, Asuka Sakata, Keitaro Yoshimoto, Mitsuki Tsuruta, Daisuke Miyoshi, Shinsuke Sando
Biomaterials science 14 ( 1 ) 232 - 239 2026年1月
Polymer conjugation is a common strategy to improve the pharmacokinetics of aptamers, yet its effects on aptamer properties are incompletely understood. Poly(ethylene glycol) (PEG) is the most widely used polymer for this purpose, but concerns about anti-PEG immune responses have prompted interest in alternative polymers. We previously reported that conjugation with the zwitterionic polymer poly(2-methacryloyloxyethyl phosphorylcholine) (PMPC) significantly prolongs the circulation time of a DNA aptamer while avoiding anti-PEG antibody recognition. In this study, we evaluated the physicochemical and functional consequences of PMPC conjugation of aptamers. Biophysical analyses suggested that the secondary structure and target-binding affinity of the aptamer were preserved, while functional consequences upon PMPC conjugation varied with the targets. The activity of a membrane receptor-targeting aptamer partially decreased, likely due to spatial constraints around the cell membrane, while RB005, targeting soluble activated coagulation factor IX, retained its full activity. In addition, PMPC conjugation significantly prolonged the in vivo plasma retention of RB005. By elucidating the effects of PMPC on aptamer properties and introducing another example that further supports the general applicability of PMPC conjugation in enhancing aptamer pharmacokinetics, these findings support PMPC as a promising alternative to PEG.
DOI： 10.1039/d5bm01078k
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Phase Separation of RX Repeat Peptides with Nucleic Acids. 国際誌
Sumit Shil, Mitsuki Tsuruta, Ryosuke Suzuki, Yoshiki Hashimoto, Takeru Torii, Shinya Taniguchi, Tomohiro Umetani, Keiko Kawauchi, Daisuke Miyoshi
Chemistry, an Asian journal 20 ( 23 ) e00805 2025年12月
Biomolecular liquid-liquid phase separation (LLPS) plays a crucial role in organizing membraneless cellular compartments, which regulate a wide variety of cellular processes. A key molecular mechanism underlying LLPS of nucleic acids involves G-quadruplex (G4) structures of DNA and RNA interacting with intrinsically disordered proteins, particularly arginine and glycine (RGG/RG) rich proteins. The role of arginine residues in LLPS has been studied extensively, whereas few studies have focused on the role of the another frequently occurring residues, glycine. Here, we systematically investigated the contribution of G residues by substituting them with alanine (A), proline (P), valine (V), and tyrosine (Y) residues, generating a series of RX repeat peptides. Turbidity and microscopy assays with DNA oligonucleotides forming G4, duplex, as well as random coil, showed that RP and RA-peptides enhanced LLPS with G4 DNA, by comparing RG-peptide. In contrast, RY promoted liquid-solid phase separation (LSPS) with the G4 DNA, although it underwent LLPS with the random coil and duplex DNAs. In addition, RV-peptide formed aggregates even in the absence of any DNA. These results demonstrate that side-chain size, hydrophobicity, and aromaticity are critical factors for the LLPS and LSPS capability and selectivity with DNA forming various secondary structures. This study provides mechanistic insights into protein-nucleic acid LLPS and LSPS and guides the rational design peptides to undergo LLPS but not LSPS with nucleic acids.
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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分子夾雑系での核酸挙動
建石寿枝、三好大輔、杉本直己（ 担当： 共著）
CSJカレントレビュー「生体分子と疾患」（化学同人） 2023年2月 （ ISBN:9784759814057 ）
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がん関連mRNAと光線力学療法
三好大輔, 杉本直己（ 担当： 共著）
CSJカレントレビュー「生体分子と疾患」（化学同人） 2021年5月
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Cell and Molecular Mechanics in Health and Disease
Keiko Kawauchi, Hideaki Fujita, Daisuke Miyoshi, Evelyn K. F. Yim, and Hiroaki Hirata（ 担当： 編集）
Hindawi Limited 2017年2月
総説・解説記事（Misc） 【 表示 ／ 非表示 】
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G4リガンドのテロメア長とTERRA発現量に対する効果
橋本佳樹, 取井猛流, 木下菜月, 川内敬子, 建石寿枝, 杉本直己, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 103rd 2023年
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テロメア長-TERRA発現関係に対する構造選択的G-四重鎖リガンドの調節効果【JST機械翻訳】
HASHIMOTO Yoshiki, KAWAUCHI Keiko, TATEISHI-KARIMATA Hisae, SUGIMOTO Naoki, SUGIMOTO Naoki, MIYOSHI Daisuke
Program & Abstracts. International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 50th 2023年
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核酸の二次構造を標的としたドロプレットの分解
鶴田充生, 取井猛流, 小畠一起, 川内敬子, 建石(狩俣)寿枝, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 102nd 2022年
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グアニン四重らせん構造選択的化合物の開発に向けたスクリーニングシステムの構築
橋本佳樹, 取井猛流, 藤田ひな, 川内敬子, 建石寿枝, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 102nd 2022年
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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DNA i-motifの液-液相分離能決定因子の探索
鈴木 涼介・川内 敬子・三好 大輔
日本化学会 第106春季年会2026 (日本大学理工学部 船橋キャンパス、千葉) 2026年3月
開催年月日： 2026年3月
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核酸とペプチドの液-液相分離に対する分子クラウディングの効果
吉川 美咲、川内 敬子、三好 大輔
日本化学会 第106春季年会2026 (日本大学理工学部 船橋キャンパス、千葉) 2026年3月
開催年月日： 2026年3月
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核酸四重らせん構造とペプチドが形成する液滴からペプチドを排除する方法の検討
綾瑞穂・橋本佳樹・鶴田 充生・川内 敬子・三好 大輔
日本化学会 第106春季年会2026 (日本大学理工学部 船橋キャンパス、千葉) 2026年3月
開催年月日： 2026年3月
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分子クラウディング環境下で核酸のi-motif DNAが誘起する液-液相分離
2026年2月
開催年月日： 2026年2月
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Nucleation and Elongation Steps in DNA G-Quadruplex Folding 招待あり
M. Nakata, N. Kosaka, M. Tsuruta, K. Kawauchi, and D. Miyoshi
18th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2025) (Scool of Medicine, Hiroshima University, Hiroshima) 2025年12月
開催年月日： 2025年12月
産業財産権 【 表示 ／ 非表示 】
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光線力学療法用剤
権田幸祐、北村成史、金野智浩、熊谷圭悟、當山亮太、中尾重治、高瀬拓夢、工藤桃子、西館智尋、三好大輔、川内敬子
出願番号：PCT/JP2024/6842
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光増感剤輸送キャリア,
大谷 亨、川内 敬子、三好 大輔
出願番号：2022-128296
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核酸鎖の四重螺旋構造の検出方法
三好 大輔、前田 龍一
出願番号：特願2013-199029
公開番号：特開2015-62388
出願国：国内
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Method for detecting G-quadruplex, method for detecting G-quadruplex-forming DNA and method for determining telomerase activity
Hidenobu Yaku, Daisuke Miyoshi
出願番号：13/335,498
出願国：外国
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テロメラーゼ活性の検出方法
夜久 英信, 三好 大輔
出願番号：２０１１－７５０２０
公開番号：２０１２－２０５５６８
出願国：国内
Works（作品） 【 表示 ／ 非表示 】
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G-Quadruplex: a Versatile DNA structure in vivo and in vitro
2007年12月
IBER International Lectures Part 9、2007年12月
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Conformational switch of a functional nanowire based on the DNA G-quadruplex
2007年11月
第5回国際核酸化学シンポジウム（第34回核酸化学シンポジウム）、2007年11月
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Effects of cosolutes on the thermodynamic stability of parallel DNA duplex and triplex
2007年11月
第5回国際核酸化学シンポジウム（第34回核酸化学シンポジウム）、2007年11月
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Functional DNA materials controlled by surrounding conditions
2007年10月
IUPAC 3rd International Symposium on Novel Materials and Synthesis (NMS-III)、Shanghai, China、2007年10月
その他研究活動・業績等 【 表示 ／ 非表示 】
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ケミカルバイオロジー2.0
2019年7月
東京化学同人 三好大輔、山東信介、清中茂樹、花岡健二郎、後藤佑樹 座談会
次世代に向けたケミカルバイオロジーについての座談会。
現代化学2019年8月号に掲載。 -
G-Quadruplex: a Versatile DNA structure in vivo and in vitro
2007年12月
IBER International Lectures Part 9、2007年12月
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Effects of cosolutes on the thermodynamic stability of parallel DNA duplex and triplex
2007年11月
第5回国際核酸化学シンポジウム（第34回核酸化学シンポジウム）、2007年11月
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Conformational switch of a functional nanowire based on the DNA G-quadruplex
2007年11月
第5回国際核酸化学シンポジウム（第34回核酸化学シンポジウム）、2007年11月
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Functional DNA materials controlled by surrounding conditions
2007年10月
IUPAC 3rd International Symposium on Novel Materials and Synthesis (NMS-III)、Shanghai, China、2007年10月
学術関係受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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村尾育英会学術賞
2015年3月 村尾育英会
三好大輔
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化学・生物素材研究開発奨励賞
2013年10月 バイオインダストリー協会
三好大輔
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ISNAC Outstanding Oral Presentation Award for Young Scientist in 2011
2011年11月 The organizing committee and executive committee of the 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2011)
D. Miyoshi
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日本化学会第91春季年会 若い世代の特別講演賞
2011年3月 日本化学会
三好大輔
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日本化学会 生体機能関連化学 シンポジウム講演賞
2007年9月 日本化学会
三好大輔
科研費（文科省・学振）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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核酸の液液相分離に着目した神経変性疾患とがん発症における逆相関分子機構の解明
2024年6月 - 2026年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 挑戦的研究(挑戦)
三好 大輔, 川内 敬子
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脳腫瘍のゲノムの高次構造を標的とした転写・翻訳制御の新時代ゲノム医療
2023年4月 - 2026年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
夏目 敦至, 川内 敬子, 三好 大輔, 古山 浩子, 加藤 彰, 鈴木 正昭
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生体分子の液液相分離制御工学構築による新規創薬モダリティの提唱
2022年6月 - 2025年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 挑戦的研究(開拓)
三好 大輔, 川内 敬子
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生体分子の液液相分離制御工学構築による新規創薬モダリティの提唱
2022年4月 - 2024年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 挑戦的研究(開拓)
担当区分：研究代表者
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核酸とタンパク質の液液相分離の分子機構解明と制御に向けた最小モデルシステムの構築
2021年4月 - 2024年3月
学術振興機構 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
三好 大輔, 川内 敬子
科研費以外の競争的資金獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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核酸とタンパク質の相分離を制御する―神経変性疾患とがんの革新的治療薬の創製を目指して－
2021年4月 - 2024年3月
甲南学園 甲南学園平生太郎基金 甲南学園平生太郎基金科学研究奨励助成
担当区分：研究代表者
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核酸四重らせん構造リガンドを用いた細胞内相分離現象の制御
2019年7月 - 2023年3月
公益財団法人 旭硝子財団 公益財団法人 旭硝子財団 ステップアップ助成
核酸四重らせん構造リガンドを用いた細胞内相分離現象の制御
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mRNAが形成する四重らせん構造の機能解明に向けたケミカルプローブの創製
2017年4月 - 2018年3月
内藤記念科学振興財団 内藤記念科学奨励金・研究助成
mRNAが形成する四重らせん構造の機能解明に向けたケミカルプローブの創製
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核酸四重らせん構造に対するペプチドリガンドのハイスループット スクリーニングシステムの構築
2015年4月 - 2016年4月
その他財団等 公益財団法人旭硝子財団
核酸四重らせん構造に対するペプチドリガンドのハイスループット
スクリーニングシステムの構築 -
細胞内で形成される核酸の非標準構造の解明
2015年3月
村尾育英会 村尾育英会学術賞
共同・受託研究活動実績（公開） 【 表示 ／ 非表示 】
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DNAを用いた新規エレクトロニクス材料の研究・開発
一般受託研究
2007年4月 - 2025年3月
グアニンに富むＤＮＡの電気的特性の評価解析およびＤＮＡと機能性有機材料との結合化技術の確立
共同研究希望テーマ 【 表示 ／ 非表示 】
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核酸が関与する相分離機構の解明とその応用
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核酸（DNA RNA）に作用する機能性分子の開発
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核酸が関与する相分離機構の解明とその応用
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生体分子を用いたナノマテリアル開発（超分子、ナノエレクトロニクス、ナノバイオ材料、ナノバイオ素子など）
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細胞内小器官への分子運搬システムの開発（ＤＤＳ、分子シャトル、アンチセンス・アンチジーンなど）
研究費にかかる研究（調査）活動報告書 【 表示 ／ 非表示 】
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2025年度 生体機能関連化学、核酸化学、生物物理化学 核酸構造が関与する生体反応の解明
研究費の種類： 教員研究費
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2024年度 生体機能関連化学、核酸化学、生物物理化学 核酸構造が関与する生体反応の解明
研究費の種類： 教員研究費
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2023年度 生体機能関連化学、核酸化学、生物物理化学 核酸構造が関与する生体反応の解明
研究費の種類： 教員研究費
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2022年度 生体機能関連化学、核酸化学、生物物理化学 核酸構造が関与する生体反応の解明
研究費の種類： 教員研究費
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2021年度 生体機能関連化学、核酸化学、生物物理化学 生体分子や合成高分子を用いた細胞内環境の精密化学模倣
研究費の種類： その他
教育活動に関する受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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日本学術振興会特別研究員（DC2）
2012年4月 日本学術振興会
受賞者： 藤本健史 -
財団法人理工学振興会研究助成
2010年12月 財団法人理工学振興会
受賞者： 藤本健史
その他教育活動及び特記事項 【 表示 ／ 非表示 】
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2018年9月-現在
生命化学
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2017年4月-現在
生体分子工学
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2012年8月
オープンキャンパス
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2011年10月
一般公開
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2011年8月
オープンキャンパス
ティーチングポートフォリオ 【 表示 ／ 非表示 】
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2025年度
教育の責任（何をやっているか：主たる担当科目）：
ナノバイオサイエンス序論 (前)（１年前期必修科目２単位）
生体分子工学 (A期)（３年前期選択必修科目２単位）
ケミカルバイオロジー (B期)（３年前期選択必修科目２単位）
ナノバイオラボ1A・１B（２年後期必修科目４単位）
科学英語コミュニケーション
エリアスタディーズV
ナノバイオ国際演習
など教育の理念（なぜやっているか：教育目標）：
受講生が、ナノバイオに関する基礎的な知識を習得し、生命を化学的に分子レベルで理解することを教育目標としている。さらには、生命科学における問題点を見出し、その解を自らが計画する研究によって解明し、世に周知し、最終的には社会に貢献するために必要となる素養を身に着けることを目指している。また、研究開発分野において社会で即戦力となるリーダーを養成したい。
教育の方法（どのようにやっているか：教育の工夫）：
学生が複雑な生命現象に対して向き合うための基礎知識を与え、本質的に理解するために疑問点や問題点を発見する機会を提供している。例えば、解が定まっていないレポートを課し、提出時にクラス内で発表させている。一つの事象に対して様々な側面からのアプローチが可能であることを体感できるように心がけている。大学院では、最先端の論文内容や他者の研究と自身の研究内容を結びつけるためのディスカッションを行っている。また、社会に出て、新しい研究開発プロジェクトを部署内で提案するような場面を設定し、レポートとプレゼンテーション、ディスカッションを行っている。また、基礎的な1年生科目に関しては、講義終了時にリフレクションペーパーを提出させ、重要であった点、理解できた点、理解できなかった点を記させることで、講義内容の整理と定着を試みている。（エビデンス リフレクションペーパー） 難しかった点が複数人の学生から出された内容について、次回の講義で復習して講義の導入としている。
大学院講義では、論文を読み、その内容、各々からみた驚くべき点、自身の研究との関連性、論文内容を基にした研究計画などを短時間でプレゼンし、皆でディスカッションをしている。
実験実習に関しては、実験することの意義、実験条件の設定方法、実験結果の測定方法、実験結果の解析方法、実験結果の他との比較によるディスカッションをまとめることができるように注意している。条件設定、測定方法、解析方法については、実験の基礎となる解析方法の理解と式の誘導、式由同時における近似等を詳しく調査させることである程度達成可能であると考えている。また、実験結果、解析結果を逐次見せに来させて、次に実験条件を設定するという作業を繰り返している。このような作業を通じて、どのようにして計画を立てていくのかを体得させるようにしている。教育方法の評価・学習の成果（どうだったか：結果と評価）：
基礎知識の習得は必ず必要であるが、これを知識の詰込みと思わせることなく、知識が有機的に結びつくことが理想であるが、１年生時における講義においては、学部の基礎となるな要を多く含むため、どうしても知識を習得させることに偏りがちである。一方、3年生の講義においては、これまでに学んできたことが「結びついている」「結びつけられた」と感じてもらえることがある程度できているように思う。多くの学生が、分からない点をとことんまで掘り下げる様子も見られ、勉強や研究に対する楽しさを感じてもらえているように思われる。（エビデンス：レポート、定期試験解答、リフレクションペーパー）
実験に関しては、得られた結果を議論して、次の実験条件の設定を行っている。また、実験の後半においては、自身で実験テーマを設定して、実験方法と条件設定について議論している。過半数の受講生は、実験を自ら進めることの面白さを理解しているように感じている。（エビデンス：レポート）改善点・今後の目標（これからどうするか）：
入学後戸惑うことも多い1年次配当科目については、受講生の習得・進捗を鑑みて講義を進める必要がある。そのためにも、基礎知識を如何に、主体的に記憶し、理解していくか、という点に関して、一層の工夫を凝らし、以降の講義に対しする取り組みの姿勢を確立することも必要であると考えている。高学年配当科目については、理解する、腑に落ちる、という機会をなるべく多く提供していきたい。そのための、ディスカッションなどについても機会を増やしていく予定である。大学院科目については、より高度なディスカッションなどが可能なることが目標である。自身の専門分野が多岐にわたる点を逆にうまく利用して、多方面から検討する重要性を提示できるようにしたい。
このような取り組みによって、講義に主体的に取り組むことが困難な受講者の改善につなげる必要もあると感じている。根拠資料（資料の種類などの名称）：
１リフレクションペーパー（非公開）
２各講義用に作成した講義資料。各講義につき、おおよそ、パワーポイントで100～200枚程度。
３レポート（非公開）
所属学協会等の委員歴 【 表示 ／ 非表示 】
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2026年4月 - 現在 日本化学会 生体機能関連化学・バイオテクノロジーディビジョン 幹事
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2019年12月 日本ナノメディシン交流協会 13th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2019)実行委員長
社会貢献活動 【 表示 ／ 非表示 】
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模擬講義／高校生（兵庫県立高砂高等学校 1年生）
2015年11月
ナノのヒケツとバイオのヒミツでナノバイオ
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模擬講義／高校生（姫路高等学校２年生）
2014年8月
姫路市立姫路高等学校模擬講義 遺伝子のヒミツとヒケツ
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出張模擬講義／高校生（兵庫県立舞子高等学校一年生）
2013年12月
遺伝子のヒミツとヒケツ －遺伝子が活躍するバイオとナノ－
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BioJapan 2013 World Buisiness Forum (Pacifico Yokohama)
2013年10月
「甲南大学フロンティアサイエンス学部分子設計化学研究室」
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ひらめき☆ときめきサイエンス
2013年7月
遺伝暗号を解く～光で視る遺伝子からタンパク質ができるまで～
提供可能な資源 【 表示 ／ 非表示 】
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生体分子の物理化学的性質の解析（構造、熱力学的安定性、相互作用解析、反応速度、溶媒効果など）、ならびに分子物性の測定（濃度、分子量、分子量分布、固体表面解析、蛍光イメージ像解析など）
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核酸標的分子のスクリーニング
様々な核酸構造を標的にした低分子化合物や中分子化合物のスクリーニングシステムの構築と提供
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核酸、ペプチド、有機化合物、無機化合物のコンジュゲート分子の作成
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ナノ構造体、ナノデバイス、ハイブリダイゼーションプローブ、アンチセンス核酸、RNAi、リボザイム設計などに有用なDNAとRNAの配列設計
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ラショナル法、あるいはコンビナトリアル法を用いた機能性核酸や機能性ペプチドの取得
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